在天台三大部中，《法华玄义》是说明《法华经》题的《法华》纲要达意论，亦可说是智者大师以《法华》为中心的佛卝敩概论；《法华文句》是以因缘、约教、本迹、观心四意，即四个层次对《法华经》的解释；《摩诃止观》则是智者大师“说己心中所行”的琺卝门，即观心大卝琺，亦即俢卝道的方法论。就是在这部典籍里，概括出了一念三千这一重要的概念。根据“心佛及众生，是三无差别”的教卝义，把诸法归结于刹那一念，以便正观正行而演说出一念三千。这一念三千的理论是智者大师晚年的思想结晶，使得一心三观的思想更进一步圆熟。由智师向上推溯，它是一大果实；向下演变，它是活水之源。所以荆溪湛然大师在《止观辅行》卷五之三云：