司马迁整部史记的目录顺序，就展现了司马迁的思想的逻辑脉络，以及司马迁的儒家思想的特点。司马迁的思想中，并没有有意抬高儒家的地位，整部史记中，司马迁基本上按照先秦与西汉初期的历史事实，以及各种人物在现实世界的重要性与作用，编排史记的目录，与此同时，司马迁给予儒学人物恰当的地位，
比如史记中世家的地位，远远高于【列传】的地位。“世家”记述子孙世袭的王侯封国史迹，和特别重要人物事迹;。整个西汉社会就是世族为主干的构架，世家即是世世代代相沿的大姓氏大家族。
班固整部汉书的目录顺序，就展现了班固以儒家思想为主的逻辑脉络，以及班固的儒家思想的特点。班固深受儒家思想的熏陶，宣传儒家思想成为他的自觉行动。在《汉书·叙传》中，他开诚布公地宣称自己编纂《汉书》旨在“综其行事，旁贯《五经》，上下洽通”，“纬《六经》，辍道纲”，其中的原因正如他在《汉书·礼乐志》中所言：“为国者一朝失礼，则荒乱及之矣。”儒家思想“所以通神明，立人伦，正情性，节万事者也”。

《汉书·司马迁传》赞语批评司马迁的《史记》不以圣人和六经作为判断事物的标准，说司马迁“是非颇缪于圣人，论大道则先黄老而后六经，序游侠则退处士而进奸雄，述货殖则崇势利而羞贱贫”，故《汉书》删除了《史记》中具有非儒思想的话语和资料。
班固把宣传儒家思想作为编纂史书的宗旨，对后世影响很大，《汉书》出现后，不仅纪传体正史大都沿袭了这一做法，而且相当多的野史编纂也把宣传儒家思想作为己任。

班固对司马迁也进行了评价。一方面肯定《史记》“不虚美，不隐恶”的实录精神，另一方面认为司马迁不能明哲保身，以及文章有不符合儒家经典之处等。
司马迁生长于未立“五经博士”以前，思想广博而生动，并且能够四处游历，深入社会生活的各个层面。班固则不同，出生于“五经博士”系统确立以后，“五经”的精神已经凝滞而僵化，学问、读书，不再是为了纯粹的求知，而是步入仕途的敲门砖，功利之心大增，求知欲望消退。所以，司马迁能够写出《货殖列传》《游侠列传》，不尊汉，列刘邦于项羽之后，班固则认为这些都抵触经艺，有门户之见，而对汉代尊崇至极。两个人的思想境界有着极大的差异，眼界也大不相同。
由于东汉时期，东亚社会发生了巨大的变化，西汉早期分封的诸侯大都飘零殆尽，所以班固不再列世家。在《汉书》里，本纪带有编年史大事记的性质，对于天子的个人的事迹记载不多，《汉书》，本纪故而显得枯燥，没有史记本纪的生动、充满生活气息。
比如，把儒家思想的礼乐思想，作为以【志】的形式构架了汉书的主要内容，比如，卷二十一上律历志第一上，卷二十一下律历志第一下，卷二十二礼乐志第二，卷二十三刑法志第三，卷二十五上郊祀志第五上，卷二十五下郊祀志第五下，卷三十艺文志第十。
举例，
班固把史记的外戚世家改为列传，汉书，卷九十七上外戚传第六十七上，卷九十七下外戚传第六十七下，卷九十八元后传第六十八。
这显然是后代儒家思想，贬低皇室的妃子与外戚的在西汉时期的巨大作用，这与西汉历史的事实是完全相反的。
班固在汉书中，单独为董仲舒立传，而把公孙弘卜式儿宽放在一起，这是东亚文化圈后来推崇董仲舒地位的开始。

司马迁作《史记》，完成于汉武帝末年。班固作《汉书》，书未成而作者因过去与外戚窦宪的关系，死于狱中，事在和帝永元四年。一属西汉，一属东汉，相去公元前及公元后各约９０年。汉书与史记，间隔了１８０年的距离，等于我们之去前清嘉庆年代。
《史记》和《汉书》一为私人著作，汉书的书稿则经皇帝看过，有国史的色彩。
公元前９０年和公元后９０年，东亚文化圈的文化思想家环境已有大幅度的变化。变化的关键在于，汉武帝用忠孝儒家思想，对东亚文化圈的文化进行了大一统的整合，创建了太学，也就是所谓的独尊儒术。
班固（公元32年～公元92年），班固出身儒学世家，自幼接受父伯的儒家思想的教育和熏陶，九岁便能文诵赋。 班固的父亲班彪当时已是远近闻名的儒家大学者。班固十六岁入洛阳太学，建初四年（79年），章帝召集诸儒在白虎观讲论五经同异，命其记述其事，撰成《白虎通德论》（《白虎通义》）。
《白虎通义》对汉武帝的忠孝儒家思想进行了全面准确深入的诠释，把汉武帝的忠孝思想，具体为“三纲”、“六纪”。
《白虎通义》运用了东亚文化圈的易经与易学的理论，对汉武帝的忠孝儒家思想，进行了理论化的形而上学的哲学范畴的全面提升。
汉书的整个思想逻辑，都是围绕汉武帝的忠孝儒家思想与《白虎通义》而展开的，也就是说，汉书是对史记诠释的汉武帝忠孝儒家思想的升华与补充。
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《汉书 卷六武帝纪第六》记载
建元元年冬十月，诏丞相、御史、列侯、中二千石、二千石、诸侯相举贤良方正直言极谏之士。
丞相绾奏：“所举贤良，或治申、商、韩非、苏秦、张仪之言，乱国政，请皆罢。”奏可。
【今注，资治通鉴●卷第十七，世宗孝武皇帝上之上建元元年。冬，十月，诏举贤良方正直言极谏之士，上亲策问以古今治道，对者百馀人。广川董仲舒对曰：“道者，所繇适于治之路也，仁、义、礼、乐，皆其具也。故圣王已没，而子孙长久，安宁数百岁，此皆礼乐教化之功也。董仲舒少治《春秋》，孝景时为博士，进退容止，非礼不行，学者皆师尊之。及为江都相，事易王。易王，帝兄，素骄，好勇。仲舒以礼匡正，王敬重焉。】
夏四月己已，诏曰：“古之立孝，乡里以齿，朝廷以爵，扶世导民，莫善于德。然即于乡里先耆艾，奉高年，古之道也。今天下孝子、顺孙愿自竭尽以承其亲，外迫公事，内乏资财，是以孝心阙焉，朕甚哀之。民年九十以上，已有受鬻法，为复子若孙，令得身帅妻妾遂其供养之事。”
议立明堂。遣使者安车蒲轮，束帛加璧，征鲁申公。
【今注，资治通鉴第十七卷·汉纪九，世宗孝武皇帝上之上。建元元年辛丑，公元前一四零年。夏，六月，丞相卫绾免。丙寅，以魏其侯窦婴为丞相，武安侯田蚡为太尉。上雅向儒术，婴、蚡俱好儒，推毂代赵绾为御史大夫，兰陵王臧为郎中令。绾请立明堂以朝诸侯，且荐其师申公。秋，天子使使束帛加璧、安车驷马以迎申公。既至，见天子。天子问治乱之事，申公年八十馀。对曰："为治者不至多言，顾力行何如耳。"是时，天子方好文词，见申公对，默然，然已招致，则以为太中大夫，舍鲁邸，议明堂、巡狩、改历、服色事。】

《汉书 卷六武帝纪第六》记载
六年春二月乙未，辽东高庙灾。夏四月壬子，高园便殿火。上素服五日。五月丁亥，太皇太后崩。
【今注，资治通鉴第十七卷·汉纪九，世宗孝武皇帝上之上 建元六年(丙午,公元前135年)太皇太后崩。 】
【今注，资治通鉴第十七卷·汉纪九，世宗孝武皇帝上之上。建元三年癸卯，公元前一三八年
时大臣议者多冤晁错之策，务摧抑诸侯王，数奏暴其过恶，吹毛求疵，笞服其臣，使证其君。诸侯王莫不悲怨。
　冬，十月，代王登、长沙王发、中山王胜、济川王明来朝。上置酒，胜闻乐声而泣。上问其故，对曰："悲者不可为累欷，思者不可为叹息。今臣心结日久，每闻幼眇之声，不知涕泣之横集也。臣得蒙肺附为东藩，属又称兄。今群臣非有葭莩之亲、鸿毛之重，群居党议，朋友相为，使夫宗室摈却，骨肉冰释，臣窃伤之！"具以吏所侵闻。于是上乃厚诸侯之礼，省有司所奏诸侯事，加亲亲之恩焉。
上自初即位，招选天下文学材智之士，待以不次之位。四方士多上书言得失，自眩鬻者以千数。上简拔其俊异者宠用之。庄助最先进，后又得吴人朱买臣、赵人吾丘寿王、蜀人司马相如、平原东方朔、吴要枚皋、济南终军等，并在左右，每令与大臣辨论，中外相应以义理之文，大臣数屈焉。然相如特以辞赋得幸；朔、皋不根持论，好诙谐，上以俳优畜之，虽数赏赐，终不任以事也。朔亦观上颜色，时时直谏，有所补益。
上以道远劳苦，又为百姓所患，乃使太中大夫吾丘寿王举籍阿城以南，盩厔以东，宜春以西，提封顷畮，及其贾直，欲除以为上林苑，属之南山。上乃拜朔为太中大夫、给事中，赐黄金百斤。
然遂起上林苑，如寿王所奏。】
【今注， 建元五年乙巳，公元前一三六年。置五经博士。
建元六年丙午，公元前一三五年，五月，丁亥，太皇太后崩。　　六月，癸巳，丞相昌免；武安侯田蚡为丞相。蚡骄侈，治宅甲诸第，田园极膏腴；市买郡县物，相属于道；多受四方赂遗；其家金玉、妇女，狗马、声乐、玩好，不可胜数。每入奏事，坐语移日，所言皆听。荐人或起家至二千石，权移主上。
上乃曰："君除吏已尽未？吾亦欲除吏。"尝请考工地益宅，上怒曰："君何不遂取武库！"是后乃稍退。】

《汉书 卷六武帝纪第六》记载
元光元年冬十一月，初令郡国举孝廉各一人。
【今注 ，举孝廉制度，是汉武帝忠孝儒家思想的重要举措，通过举孝廉的选用人才的制度，可以在西汉整个社会的上上下下，形成一个汉文化的核心共识，就是只有那些忠孝两全的人，才是汉武帝朝廷真正需要的人才，举孝廉的制度与举贤的制度有着重大的差异，苏秦张仪也许属于贤人，但是苏秦张仪不属于孝廉，孝廉制度完全是儒家思想的产物。
孝廉制度，对于后来的科举制度而言，还是有着巨大的优点，孝廉制度源于儒家思想的圣人思想，而科举制度仅仅是依靠文章来判定一个人的才能，就如同用军功作为唯一的标准选材，这对于汉武帝的忠孝标准而言，这远远不够的。曹操就是孝廉，对于曹操而言，忠孝是一个人是否可以使用的最基本的前提条件，故而曹操对关羽的忠诚行为十分赞同，故而才有关羽千里走单骑的美名。
因此，在东亚文化圈的历史发展进程中，忠孝思想成为儒家心学思想最基础的内容，王阳明与曾国藩都是真正的孝廉式的圣人，王阳明与曾国藩都对家人十分关爱。王阳明之所以后来远赴贵州服从朝廷的惩罚，有个重要的原因，是担心自己的父亲与家人可能遭受牵连。曾国藩的家书，更是证明曾国藩在现实世界中，处处以家人的安危与平安与否，作为具体行动选择的重要判断依据。

《汉书·窦田灌韩传》记载：田蛤娶亲，太后命令列侯、宗室贵族都前往祝贺。灌夫在酒席上不满众人讨好田蛤而冷落窦婴，借酒骂座，被田蛤扣押。窦婴上书为灌夫辩护，武帝命令廷辩。在辩论中诸大臣各执一词，不能定案。武帝下朝侍奉母亲进餐，早就听到消息的王太后怒道：“我在也，而人皆藉吾弟，令我百岁后，皆鱼肉之乎！且帝宁能为石人邪！此特帝在，即录录，设百岁后，是属宁有可信者乎？”武帝为了不件逆母亲，连忙道歉：“俱外家，故廷辨之。不然，此一狱吏所决耳。”后来，武帝族诛灌夫全家，并将窦婴弃市。
《汉武故事》载：“太后弟田蛤欲夺(窦)太后兄子窦婴田，婴不与。上诏大臣议之，群臣多是窦婴。上(武帝)亦不复穷问，两罢之。田蛤大恨，欲自杀，先与太后诀，兄弟共号哭诉太后。上不得已，遂乃杀婴。”这两段记载虽然不尽相同，但有一点是一致的，那就是在对此事的处理上，武帝顺从了母亲的意思。
其实，对于窦太后，武帝又何尝不是如此呢？武帝即位之初，慑于窦太后之威，仍然推行黄老之治。窦太后去世不久，即罢黝百家，独尊儒术。这虽然一方面是由于武帝势力不够强大，但另一方面也不能忽略，那就是他对祖母的亲情使他不能采取强硬手段。

吴楚七国之乱以后，诸侯王虽然还有封邑，但是已经没有军队，不能自行任免官吏。
不仅如此，朝廷还派专门的官员监视他们，一旦发现诸侯王有越轨行为就向朝廷汇报，诸侯国官吏奉行汉法则宁严勿宽，甚至造成诸侯王“或无罪，为臣下所侵辱，有司吹毛求疵，答服其臣，使证其君，多自以侵冤”的状况。
《汉书·景十三王传》记载，建元三年(前138年)，代王登、长沙王发、中山王胜、济川王明来朝，武帝设酒招待。席间刘胜闻乐声而哭泣，武帝问其原因，刘胜便谈了上述感受和朝廷官吏侵害的具体情况。武帝听后，“乃厚诸侯之礼，省有司所奏诸侯事，加亲亲之恩焉。”
武帝还有三个姐姐一个妹妹。修成君、平阳公主、南宫公主是姐姐，隆虑公主为妹妹。修成君即王太后入宫前所生的女儿。武帝不仅把她接回皇宫，而且还赏赐给她许多钱、奴掉、田地，另外还赐其汤沐邑，号修成君。
平阳公主，汉景帝刘启与皇后王娡的长女 ，汉武帝刘彻同母姐。汉武帝即位后，她被尊为长公主。曹寿去世后，再嫁汝阴侯夏侯颇。元鼎二年（前115年），夏侯颇畏罪自杀，她再嫁大司马卫青。死后陪葬于茂陵。汉武帝的皇后卫子夫和宠妃李夫人都是通过她得到武帝临幸。
《汉书》曰：孝武卫皇后，字子夫，为平阳公主讴者。武帝即位数年，无子，过平阳公主。既饮，讴者进，帝独悦子夫。帝起更衣，子夫侍尚衣，轩中得幸。还坐悦甚，赐平阳公主金千斤。

但是，汉武帝的忠孝思想是十分复杂、玄妙与高深莫测地，不仅仅儒家与一般人所理解的普通的【忠孝】二字。
汉武帝忠孝思想的最终目的，还是为了天下的长治久安与和平稳定。
由此汉武帝的忠是大忠，是对天下的忠，
汉武帝的孝不仅仅是对天子的孝，而是对天下与天道的大孝顺，这一点可以通过捩太子与钩弋夫人事件，得到清晰的论证。
大忠大孝，才是汉武帝的玄妙高超的治国之道。大忠大孝，汉武帝对待窦太后、王太后、窦婴、田蚡、卫皇后、卫青、太子、王子等直系亲属，刘姓诸侯王，以及各个有功的大臣、将军们的政策，证明了汉武帝的文治武功，不仅仅为了自己的私欲，而是一心为公、为天下也。

《史记 卷四十九 外戚世家第十九》记载。钩弋夫人姓赵氏，河间人也。得幸武帝，生子一人，昭帝是也。武帝年七十，乃生昭帝。昭帝立时，年五岁耳。
卫太子废后，未复立太子。而燕王旦上书，愿归国入宿卫。武帝怒，立斩其使者於北阙。
上居甘泉宫，召画工图画周公负成王也。於是左右群臣知武帝意欲立少子也。
后数日，帝谴责钩弋夫人。夫人脱簪珥叩头。帝曰：“引持去，送掖庭狱！”夫人还顾，帝曰：“趣行，女不得活！”夫人死云阳宫。时暴风扬尘，百姓感伤。
使者夜持棺往葬之，封识其处。
其后帝闲居，问左右曰：“人言云何？”左右对曰：“人言且立其子，何去其母乎？”
帝曰：“然。是非儿曹愚人所知也。往古国家所以乱也，由主少母壮也。女主独居骄蹇，淫乱自恣，莫能禁也。女不闻吕后邪？”
故诸为武帝生子者，无男女，其母无不谴死，岂可谓非贤圣哉！昭然远见，为后世计虑，固非浅闻愚儒之所及也。谥为“武”，岂虚哉！

《汉书 卷六十三　　武五子传第三十三》记载。
武帝末，卫后宠衰，江充用事，充与太子及卫氏有隙，恐上晏驾后为太子所诛，会巫蛊事起，充因此为奸。
是时，上春秋高，意多所恶，以为左右皆为蛊道祝诅，穷治其事。丞相公孙贺父子，阳石、诸邑公主，及皇后弟子长平侯卫伉皆坐诛。语在《公孙贺》、《江充传》。
太子之亡也，东至湖，臧匿泉鸠里。主人家贫，常卖屦以给太子。太子有故人在湖，闻其富赡，使人呼之而发觉。吏围捕太子，太子自度不得脱，即入室距户自经。山阳男子张富昌为卒，足蹋开户，新安令史李寿趋抱解太子，主人公遂格斗死，皇孙二人皆并遇害。
久之，巫蛊事多不信。上知太子惶恐无他意，而车千秋复讼太子冤，上遂擢千秋为丞相，而族灭江充家，焚苏文于横桥上，及泉鸠里加兵刃于太子者，初为北地太守，后族。
上怜太子无辜，乃作思子宫，为归来望思之台于湖。天下闻而悲之。太子有遗孙一人，史皇孙子，王夫人男，年十八即尊位，是为孝宣帝

刘剧一出生，汉武帝对刘剧抱有厚望，汉武帝对刘剧精心培养，继石庆之后，先后有严青翟 [18] 、石庆之子石德 任太子少傅，赵周 、周勃之孙周建德] 、卜式任太子太傅。刘剧成年后，性格、学识、思想、交往的人群与汉武帝有很大的区别，刘据性格仁慈宽厚、温和谨慎，故而汉武帝与刘剧之间有了误解，
故而《资治通鉴·卷二十二 孝武帝下之下 天汉三年 太始二年 太始三年 太始四年 征和元年 征和二年》记载：
征和元年。冬，十一月，发三辅骑士大搜上林，闭长安城门索；十一日乃解。巫蛊始起。
丞相公孙贺夫人君孺，卫皇后姊也，贺由是有宠。贺子敬声代父为太仆，骄奢不奉法，擅用北军钱千九百万；发觉，下狱。是时诏捕阳陵大侠硃安世甚急，贺自请逐捕安世以赎敬声罪，上许之。后果得安世。
安世笑曰：“丞相祸及宗矣！”遂从狱中上书，告“敬声与阳石公主私通；上且上甘泉，使巫当驰道埋偶人，祝诅上，有恶言。”
　　世宗孝武皇帝下之下征和二年
　　春，正月，下贺狱，案验；父子死狱中，家族。
闰月，诸邑公主、阳石公主及皇后弟子长平侯伉皆坐巫蛊诛。

故而《资治通鉴·卷二十二 孝武帝下之下 天汉三年 太始二年 太始三年 太始四年 征和元年 征和二年》记载：
初，上年二十九乃生戾太子，甚爱之。及长，性仁恕温谨，上嫌其材能少，不类己；而所幸王夫人生子闳，李姬生子旦、胥，李夫人生子髆，皇后、太子宠浸衰，常有不自安之意。
“上觉之，谓大将军青曰：“汉家庶事草创，加四夷侵陵中国，朕不变更制度，后世无法；不出师征伐，天下不安；为此者不得不劳民。若后世又如朕所为，是袭亡秦之迹也。太子敦重好静，必能安天下，不使朕忧。欲求守文之主，安有贤于太子者乎！闻皇后与太子有不安之意，岂有之邪？可以意晓之。”，。
汉武帝晚年，对于太子刘剧十分想念。
上每行幸，常以后事付太子，宫内付皇后。有所平决，还，白其最，上亦无异，有时不省也。上用法严，多任深刻吏。太子宽厚，多所平反，虽得百姓心，而用法大臣皆不悦。皇后恐久获罪，每戒太子，宜留取上意，不应擅有所纵舍。上闻之，是太子而非皇后。群臣宽厚长者皆附太子，而深酷用法者皆毁之。邪臣多党与，故太子誉少而毁多。卫青薨后，臣下无复外家为据，竞欲构太子。