此版本里的四个主角与后来的仙剑四之间的相似度相当之高，甚至连多年之后的古剑二都能看到其痕迹。

由于王世颖曾经和某树在微博上大战。由二人的交锋可以得知，此版本是以宝石而命名的，姑且称之为仙剑三宝石稿。

在当年公开发表的文章《仙剑三内幕直击：缘起轮回之章》里，出现了另外三个版本，此时的地点已经来到上海。

.由报道可知，王世颖自己又写了一版，也就是“姚仙基本满意，但评价为麻辣烫”这一版。姑且称之为“王版”。
.工长君本人写了一版，姑且称之为“工版”。
.而王后面又结合了“王版”和“工版”的内容，完成了最终企划大纲。
.仙剑三宝石稿可以看做1.0，王版/工版可以算是2.0，最终企划大纲算是3.0.
.我们最终看到的仙剑三算是4.0。
.3.0和现有剧本已经非常接近了，和现行版仙剑三的区别在于没有重楼这个角色。
.重楼这个角色是张孝全提议的产物，王世颖为此又再一次的修改了剧本。这才有了我们现在看到的现行版仙剑三。
.所以从公开发布的信息来看，仙剑三大改了五次，有四个版本的废稿，除了3.0版外，其余几个版本互相之间的区别相当大。

有一种说法是，游戏制作是先做场景，再进行剧情串联。所以剧情与场景之间自然会有割裂感，（比如九顶山，你完全感觉不到这张地图能起到多大的剧情推动作用，更像是这个场景已经做出来了，不能浪费必须得用上）。但这种情况显然不能反应真实情况。初版的规划和场景地图之间肯定是能够对应的，没有规划，哪有场景呢？后来出现的割裂感更多的是因为制作过程中改了稿。因为改稿子很容易，动动笔就可以了，但改场景的难度就大得多。即使剧情改没了，但资源不能浪费。

有以上四个稿子在手，再结合游戏解包，我们就能解释以上大部分的问题。
比如紫萱一个苗女为什么会开那么大的船，这船是哪里来的？
宝石稿中就有答案，因为紫萱的原型是宝石稿的女二（相关见20楼）
这个角色最初可不是什么女娲后人，而是一个江洋大盗。
景天他们实际上坐的是女江洋大盗的海盗船。海盗当然不会飞。所以紫萱这么强的女娲后人也就变得不会“飞”了。
虽然把这个角色从女2改成改成女3，江洋大盗改成女娲后人。
但相关的地图，长江，海，都已经做出来了。

显然不能将这些创意浪费掉。
于是紫萱一个苗疆少女也能开超级大船了。
这船一个船夫也看不到，还五脏俱全到可以买东西，简直可以说是仙船。

那么徐长卿为什么不会飞呢？这个就比较难以揣测，剧情需要他不会飞肯定是说不通的。
硬性解释蜀山弃徒所以不用师门御剑之术，但之前为何又要传授景天蜀山心法呢？传授他人使得，自己用就使不得了？
也可以将徐长卿所言：从陆路赶回蜀山（6楼），属于写嗨了，长卿的“从陆路赶回”实际上就是御剑从陆地上空飞回的意思。
要真从陆路“赶回”，不一定比坐方总镖头的船快。

霹雳堂为何对花楹视而不见，留着不绑等过年？（9楼）
这个解完游戏包就可以发现原因，因为花楹作为四号位女主，它的预设出场时间很晚。

游戏文件包编号，女一号104雪见，女二号105-106龙葵，女三号107紫萱，108才到花楹。
如果以这个位置来倒推早期规划，那么可以得出紫萱比龙葵先出场，花楹出场比紫萱还要靠后。
即开场花楹（真身出场，不包括对话提及）的戏份都是后面增补的剧情。
霹雳堂弟子对花楹“视而不见”的原因，不是因为他们够笨，而是因为这场戏本身是没有花楹在场的。
以至于后面只能用“笨”来将这段内容合理化。

重楼取出魔剑导致锁妖塔损坏，邪剑仙等大量妖魔出逃，这是仙剑三开场不久即发生的大地震事件。当然，这段剧情在早期的规划里，未必是我们现在看到的样子。我们现在看到的版本是锁妖塔损坏，重楼取剑导致损坏，但并未倒塌。但在镇江，长卿从镖局听到的消息却是这样的：
————
长卿：听方兄说蜀山锁妖塔倒塌了，有很多妖类逃出，蜀山伤亡惨重……
景天：不会吧？难道渝州闹妖怪也是因为锁妖塔？
————
远在雷州的云霆听到的消息是这样的：
云霆：这几月听说和蜀山锁妖塔倒塌有关，之前数年……雷州也屡有妖孽滋扰，是否有关风水、地脉？
————
实际上我们看到的成品里锁妖塔只是损坏而已，那么整座塔倒塌只是以讹传讹的谣言吗？我们来看看蜀山弟子自己是怎么说的？
常行：锁妖塔倒塌，蜀山已经伤亡惨重，再来一个邪剑仙，简直是雪上加霜……
————
蜀山弟子自己都是这样说，那这件事就不是谣言那么简单了。

这明显指的是两个不同的剧本，一个对应锁妖塔损坏版本，一个对应锁妖塔倒塌版本。
这两个版本的区别在于有没有重楼，有重楼，那么重楼取剑对应锁妖塔就只是损坏，接下来的剧情就是重楼当剑。在没有重楼的早期版本里，锁妖塔就是整座倒塌掉的，而魔剑在这个版本里则是自己逃出锁妖塔，最终找到景天。那么在这个版本里，又是谁造成的大地震呢？
邪剑仙自己在塔里能修炼出这个实力吗？
这个方向因为牵扯过多，暂不详细分析。

前面提到，花楹撞墙的剧情是后面改稿增补。花楹被安排提前出场，相应的霹雳堂剧情就更改了时间线。
因为头天晚上蜀山地震，邪剑仙出逃，雪见拜托景天修复紫砂壶，第二天霹雳堂舵主就来找唐益索要五毒珠。不到一天的时间足够发生邪剑仙勾搭罗如烈，罗如烈安排手下找唐益要五毒珠的事情吗？

中年男子：……五毒珠可不是一朝一夕就可以炼成的，那五毒兽百年来也就捉到这么一只，不是已经说好的吗？罗堂主为何突然着急起来？！
老者：你有所不知，堂主的神火功已练到第九重，而且……已经不是一般的内功，而是仙术了。而且……那个人简直是神通广大，罗堂主有了这人撑腰……所以你最好……
中年男子：那可不行，五毒兽可不是什么人都能养的，你们哪里给它寻那么多毒物？还要结合阴阳四时灵气的运行喂养……
老者：你不要小看我们……怎么样了？还有…………你别想耍我！
中年男子：我哪里敢？老家伙现在只剩下一口气，不会碍事的！你说的那个事，一定是堡里的小姑娘偷偷拿废掉的暗器炼的，没有什么毒性，不用独门解药来解也不会有事情！

罗如烈早就想要五毒珠了，想要五毒珠在邪剑仙出逃之前，且一早就和唐益约定好了五毒珠交付的时间。
霹雳堂此次前来催促五毒珠，明显是因为邪剑仙的到来，让罗如烈改变了计划。
那么罗如烈的原计划又是什么？
“你说的那个事，一定是堡里的小姑娘偷偷拿废掉的暗器炼的”
霹雳堂弟子中了唐门的毒，前来找唐益是来找他要解药，催促五毒珠是顺便的事情，并带来邪剑仙已经和罗如烈已经勾结成功勾结的消息。
那么是哪个小姑娘提前和霹雳堂弟子交手并用暗器毒伤了他们？

游戏里没有明确说明，我们可以猜测这个和他们交手的小姑娘就是雪见。
雪见和霹雳堂的人在九龙坡，宾化多次交手，并用毒蒺藜刺伤了他们，这个属于早期规划。
这段被改掉之后，倒霉鬼变成了景天，索要解药也变成了景天。
而要解药本该发生在霹雳堂的人身上。
所以这段霹雳堂前来兴师问罪的剧情属于是后面发生的事情被前置了。一开始根本就没有唐家堡的剧情。

从游戏解包出来的城市序号来看，第一个城市是渝州01，但第二个城市就到宾化了。唐家堡的序号是05，甚至还在蓬莱之后。
至少在场景建模的时刻，正式踏足唐家堡的剧情是安排在后面的，所以编号在后。因为改稿，所以唐家堡和花楹都提前出场了。

在大渡口，雪见这句对白也很奇怪。
雪见：不行的！他们对我不好，只有爷爷疼我，但是爷爷已经病得神智不清了，他们还在算计爷爷，为争掌门打得头破血流。
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唐家堡的掌门争夺战被安排在接到五灵珠任务之后，雷州之前。
前期唐坤还没死，唐家人可以说明争暗斗，但怎么也不至于这个时候就“头破血流”才对。
这个时期唐家内部就已经开打，可见改稿之后唐家堡剧情的时间线已经有些乱套了。