1~4集不变，第5集删除，结局篇加一集。
《极光入侵》：增补剧情，迦南星人在被泰信拒绝后嘲讽泰信：“还以为你们地球人的科技有多强，原来只会剽窃！”以阿斯加隆为骄傲的泰信当然忍不了这样的嘲讽，但迦南星人没有多做解释。事后，泰信望着阿斯加隆，若有所思。
《彩虹显现上下篇》：不变。
《声之星》：蝉星人登场前加一句台词：“看来我们的任务要提前了。”其余不变。
《亲子》：故事不变，在镜头语言上做一点调整：增加弦人注意到阿斯加隆吃瘪，队员遇险的镜头，可以与布莱泽注意到迪玛迦的镜头衔接起来，暗示二者的关注点不同，因而在行动上产生了分歧。
12~15集不变。
《晨昏之间》：将小纯的两个朋友改为外星人，结尾时向小纯坦白，那个宇宙射线是父母在叫他们回家，只是没想到在地球上会产生把画变成实体的作用，外星小朋友说：“我们要回家了，大人们说地球是个危险恐怖的地方，可是地球上明明有纯这样的好朋友......只要加巴顿还挂在那里，整个宇宙都是我们的秘密基地！”
《来自地底的恐怖》：增加剧情，布莱泽也中了莫古乔的幻术，弦人看到的却只是一团模糊的阴影，并感受到了布莱泽的不安，尽管他们很快一起克服了恐惧，击败了莫古乔，但弦人也对此产生了忧虑，可惜布莱泽似乎也无法准确地描述是什么令他恐惧。
《流浪者斩击鲁》：灵体怪兽删去列维拉，改为月光怪兽。斩击鲁告诉弦人有强烈的愿望未能达成时，就会变成执念的灵体。
《耸立的恐惧》：结尾处增加剧情，弦人欣慰地看着妻子牵着儿子快活地走在前面，辉石突然烫了他一下，他取出辉石，默默询问，布莱泽你也在思念家人和朋友吗？辉石闪烁一下，而远方，66号设施中，也有什么东西发出了光芒，似乎在应和着它......
《光与火》：开头增加剧情，惠美去指挥室找弦人汇报66号设施的异常，却没有见到他，于是联系他在咖啡馆见面，匆忙间并没有注意到自己的项链与弦人桌上斩击鲁的水晶产生了共鸣，发出淡淡的光芒......法德兰剧情不变，笔记中改一句话，由“如果他们再次来到地球，希望能和他们好好谈谈。”改为“如果试验能够成功，也许就能和他们好好谈谈了。”土桥出现，告诉惠美和弦人，由于SKaRD擅自出动和私自调查，榛野烈已经被停职了，原本SKaRD也要解散，在他的力保下才得以幸免。惠美追问v99是什么，土桥说看到惠美如此执着，他很同情，也很感动，所以透漏一些消息，v99是1999年携带着宇宙怪兽入侵地球的外星人，被防卫军阻击后落在地球，当年苍边树的试验没有成功，怀疑也是被他们破坏的。现在他们又派遣了巴赞甲和盖巴鲁加两波攻势，作为前线部队，应该专心思考如何迎击敌人，笔记也应该作为机密文件上交。
这就是答案吗？惠美和弦人将信将疑，但迫于土桥的压力，只得上交了笔记。

结局前篇：阿斯加隆带着布莱泽返回地球，瓦拉隆紧追其后，吸收布莱泽地能量后，它的速度明显变快了。辉明指出瓦拉隆在吸收能量的同时也在复制对方的能力。由于瓦拉隆的攻击，阿斯加隆没能抓住布莱泽，只得艰难返回机库。就在整备班加紧维修阿斯加隆时，瓦拉隆开始在布莱泽身边放置炸弹，它要彻底消除这个最大的障碍。危急时刻，大大小小的迪玛迦钻出地面，啃食起瓦拉隆的炸弹，塔加努拉和月光怪兽也向瓦拉隆发起攻击，然而瓦拉隆此刻实力更胜以往，血红的闪电攻击下，地球怪兽纷纷倒下。就在此时，天空中出现了v99的舰队，土桥称第4波攻势已经到来，要求SKaRD立即迎战舰队。望着倒下的布莱泽，战斗的怪兽和逃难的群众，弦人断然拒绝，却因为受伤一时间无法说出完整的句子，辉明扶起弦人，坚定地说：“怪兽尚且懂得知恩图报，守护家园，我们人类难道能抛下战友，罔顾生命吗？”SKaRD几人交换了眼神，弦人最后回复：“我们SKaRD，要去做我们该做的事了。”“Wilco！”泰信和杏梨回答。SKaRD投入了战斗，泰信和辉明驾驶阿斯加隆，杏梨和弦人驾驶mopy在地面配合，与弦人熟悉的部队也响应起来，或提供支援，或疏散群众。
土桥愤怒地说：“你们这是要造反吗？”
“我支持他们！”说话的是参谋长，与他一同走进指挥室的是惠美和西崎。惠美拿出被土桥企图损坏的笔记，上面记录着经过研究，v99飞船与怪兽并非同源，飞船还存在损坏痕迹。西崎回忆起三年前的事件，苍边树推测v99飞船可能是在受到瓦拉隆的袭击后逃向地球，却被防卫队误认为宇宙怪兽而攻击。他希望利用虫洞技术积极联络v99，妥善处理此事。西崎却认为人类不应该向陌生的文明暴露自己，意见不同两人产生了争执，但更多的研究人员支持苍边树，西崎只得妥协。这时土桥找到了他，表示支持他的意见，地球攻击了v99的飞船，使用了他们的技术，他们很可能向地球发难，提出过分的要求。西崎在土桥的授意下暗中修改了虫洞装置的程序，原本只想阻止与v99的联络，却不料发生了爆炸......随后土桥封锁了研究结果，将v99技术投入武器开发，制造了阿斯加隆。西崎害怕自己被追责，如果惠美知道真相更不可能宽恕他，所以一直隐瞒此事，甚至帮助土桥引导惠美寻找笔记。但现在地球危在旦夕，他意识到自己必须把真相说出来。

战场局势也在发生变化，补刀布莱泽不成，瓦拉隆突破了阿斯加隆和地球怪兽的阻击，向着66号设施走去，但它收起了尖利的爪牙，也没有再向地面发动攻击。
有人注意到这点：“也许瓦拉隆的目标不是地球，而是v99的虫洞装置？”
也有人反驳：“它是想有了这个力量，就能到任何地方实施侵略了吧？”
土桥说，巴赞甲和盖巴鲁加的出现已经证明v99的恶意，他们现在按兵不动，就是在等地球在与瓦拉隆的战斗中耗尽了力量，从而趁虚而入占领地球。既然瓦拉隆的目标不是地球，现在应该让他们自相残杀。他命令阿斯加隆撤出战斗，同时全球的高射炮锁定v99。
惠美说：“也许巴赞甲和盖巴鲁加的出现，是因为他们和我们一样，将地球误认为是瓦拉隆的栖息地？而现在瓦拉隆的行为，是在有意加深这种误解，继续挑拨v99和地球的对立。”
土桥嘲笑：“真是天真的猜测。”
泰信注意到阿斯加隆接收到一段声波，竟然与先前小阿播放给他的非常相似。“这是v99的语言吗？”他惊喜地说，“小阿你能与v99对话？”
惠美恍然，当年科学家在联络v99之前，应该进行过相应的准备，而他们解析v99语言的程序就被封存在了阿斯加隆的程序中。
“应该将当年没有完成的对话继续下去！”一部分人支持惠美。
“v99也许还在仇视我们，让他们两败俱伤，才对地球最有利！”另一部分人支持土桥。
惠美据理力争：“为了利益逃避错误、一错再错，这样思考的我们，与瓦拉隆又有什么区别？我们人类有一天也将迈向宇宙，应该用实际行动证明我们是有责任感的文明，不是自私、贪婪的怪兽！”
闻言，杏梨想起了蝉星人告别的话语，弦人耳边则回响起儿子的问题：“如果外星人也在看我们，会不会也感到害怕？”他们表达了对惠美的支持：“掩护阿斯加隆，与v99对话！”
察觉到人类意图的瓦拉隆向阿斯加隆发动了疯狂的攻击，它还吸收了许多地球怪兽的能量，进化到第三形态。杏梨和弦人拼尽全力吸引瓦拉隆的注意，就在阿斯加隆终于突破封锁时，瓦拉隆的闪电也即将击中mopy！

大结局：千钧一发之际，一道光芒包裹了mopy，弦人再次感受到了辉石的温度，听到了布莱泽的声音：“我们......去解决......”弦人在光芒中握住了布莱泽的手，这次他们不会再分开！
布莱泽虽然醒来但仍然虚弱，在地球怪兽的协助下艰难抵挡着瓦拉隆的攻击。阿斯加隆终于进入太空，小阿解析出v99的信息：“蓝色星球，怪兽，虫洞，恐怖！”泰信和辉明向v99传递了“误会，道歉，联合。”的消息。v99默然许久，似乎也在分析地球情报的可信性。
“被用枪指着脑袋时，如何能产生信任？”辉明说，“请给我们一点时间，解除对v99的锁定！”
越来越多的国家响应了辉明的请求，阿斯加隆也向v99发出“信任”的讯息。
“信任”v99回复。
v99舰队向瓦拉隆发起攻击，同时也遭到了瓦拉隆的还击，不时有飞船受损。
阿斯加隆在返回地球时被瓦拉隆击中，失去了行动能力。布莱泽也的力量也到了极限。
辉明提出：“我们把力量传递给布莱泽！”
阿斯加隆和v99飞船一起将能量转换为光芒投向布莱泽，光芒中，新的辉石出现了！布莱泽向瓦拉隆发出光线，那是人类、v99和光之星，所有向往和平的人们共同的力量，终于打败了猜疑、恐惧和贪婪的具象化——瓦拉隆。
战后，土桥和西崎都被逮捕，人类提出向v99归还虫洞和阿斯加隆，v99收回虫洞，却将阿斯加隆留在了地球。“未来”他们这样说，就让阿斯加隆守护地球的未来吧。
新辉石让布莱泽获得了虫洞穿越的能力，这或许是v99因为前两波攻势的误伤对他的补偿。弦人与家人团聚后，对布莱泽说，如果他想回家，随时都可以回去，布莱泽却用辉石烫了他一下。

主要的思路是将瓦拉隆和v99剥离开来，首先提高最终boss的b格，其次，虽然可以理解原作“在对方意图未知时，仍要抱有信任，坚持沟通”的意图，但个人感觉实在没有比赶尽杀绝更大的恶意了，这也让我对这个结局有点难以接受，最后，给v99对地球的恐惧一个具象化，他们不是没有再做调查，而是自认为已经足够了解了，地球栖息着可怕的怪兽，并且已经掌握了他们的虫洞技术，对他们的生存构成了威胁，这样或许会比较容易理解v99的行为。

剧场版反而不知道该怎么改，因为不知道大人留下的烂摊子让孩子解决、因为大人的忽视导致孩子出现心理问题以及应不应该发展长生不老技术哪个才是原作想表达的重点。如果是第一个，可以真的写大人做错了事孩子在弥补，如果是第二个，可以写成简单的家庭沟通故事，不要加入太多jz，如果是第三个，应该把这个孩子当成大人，好好谈一谈科技发展和使用的问题，不要拿“太寂寞”敷衍他

这个改编大概是背离原作的意图了，算是个人对战争的一点思考。读历史的时候很喜欢看一些阳谋，看似平平无奇，却能让被计算的一方主动走入彀中。合纵连横就是非常经典的阳谋，弱小者联合起来对抗强者，听上去顺理成章，但现实中“合纵”却往往会败给“连横”。因为合纵的前提是让渡自己的部分利益（可能是贪欲，也可能是求生欲），放下宿怨、戒备与猜疑，为“盟友”抗伤害，而强势方恩威并施、拉拢怀柔、挑拨离间，就能让原本各怀心事的联盟分崩离析。所以在这个故事中，即使地球和v99是没有语言障碍的两个文明，“信任”二字说来简单，却也会重似千钧。（可惜楼主笔力不济，写到后面还是觉得很刻意……）
另外想夸一波《盖亚》，从未露面的根源性灭亡体就是使用“阳谋”的高手，稍加挑拨就使得人类、地球怪兽甚至宇宙怪兽都在惶恐不安中相互争斗；在极致压迫感的同时又予以一线希望，从而击溃对手的心理防线，迫使对手臣服。而化解这种阳谋就需要在坚定心志的同时去沟通，去理解，去团结一切力量。这就是《盖亚》这部作品让我觉得非常有意思的地方