生物有机肥料是指特定功能微生物与主要以动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源冰晶无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料，是近年来随着城乡固体有机废弃物数量的不断增加和微生物技术的发展，在有机肥商品化使用的基础上研制而成的新型肥料。

生物有机肥料区别于仅利用自然发酵（腐熟）所制成的有机肥料，其原料经过生物反应器连续高温腐熟，有害杂菌和害虫基本被杀灭，起到一定的净化作用，生物有机肥料的卫生标准明显高于传统农家肥，也不是单纯的菌肥，是二者有机的结合体，兼有微生物接种剂和传统有机肥的双重优势。