各不相同的世界，存在于不同的时空中。有爱因斯坦发明时光机，回到过去杀死希特勒的时空，也有爱因斯坦被另一批时空旅行者杀死的时空。
这些各有差异的时空被称为平行世界，本应没有任何交集的可能性，但在21世纪初的某一天......
发生在某个世界的时空震动让分隔这些世界的壁垒被破坏，各个平行世界开始交汇融合，最终诞生出新的多元世界。
伴随新世界诞生的还有新的邂逅，在多方努力下很快便重新建立起秩序，局势逐渐恢复平稳。
但事情远未结束，与新世界一起诞生的还有迷之巨兽，每次出现皆会造成严重的伤亡，现代军武难以伤及分毫，如果说巨大的时空震动是第一次冲击，那巨兽的出现就是第二次冲击。
但多元世界也运用不同世界的科技 魔法将巨兽一次又一次的击退。
而在远东，名为修卡的秘密结社开始大肆活动，以征服世界为目的而行动，与各方势力交战。
为击退巨兽与修卡，各势力联合建立新组织【百系】与其据点【公馆】。
故事也由此开始....