布克最终遭遇了持有操电术的斯菜特，而后者只求一死。如果布克选择饶他一命，斯菜特会将布克视为和“康其托克的那群锡兵”一样。如果布克如他所愿地动手，斯莱特会欣慰地感叹布克在离开军队后还是没有失去士兵本色。这—评论令布克大为震惊．伊丽莎白也注意到了这一点。

原文的配图不好找啊，各位只能将就看吧，等文章更新结束我会把原文拍照上传的

登上飞艇后，伊丽莎白发现布克欺骗了自己．显得伤心欲绝。在布克打算安慰她的时候，伊丽莎白突然将其击昏。随后她便离开了飞艇，将这里和布克一起留给了菲茨罗伊（Fitzroy）领导的民众之声(Vox Populi)。在布克醒来后，菲茨罗伊向他提出了一个交易，如果他能为叛军前去芬克顿（Finktown）取来枪支，那么他就能重获飞艇。

在芬克顿寻找枪匠的过程中，布克和伊丽莎白意识到，他们无法在当前的宇宙中完成这一任务——因为在这个时空中枪匠已经死了。但他们想到了可以利用伊丽莎白的能力前往另外的宇宙找到枪匠完成任务。最终他们来到一个民众之声成功发起暴动的宇宙，在这个世界中布克为了他们的事业而捐躯。亲眼看到布克死去的菲茨罗伊看到又一个布克出现备感困惑，她认为这人是个冒牌货，因此派出大量手下追杀二人。在且战且行中，布克发现多名康斯托克手下的头皮被作为战利品陈列，看起来这个世界中的布克并没有为自己在伤膝河的所作所为感到痛悔，他还是一如往日般残暴。

布克和伊丽莎白赶上了菲茨罗伊，眼看着她在密室中杀掉了芬克(Fink)，并准备对旁边的孩子也痛下杀手。在伊丽莎白的坚持下，布克将她从通风口送进密室。布克用质问她暴行的方法来分散菲茨罗伊的注意力，而后者以嗜血的狂，热回应布克，此时伊丽莎白出现在她背后刺死了菲茨罗伊。

商业区
飞艇坠毁后，布克和伊丽莎白遇到了鲁特斯二人并从他们口中了解到有一种乐器可以控制鸣鸟，随后布克和伊丽莎白向着康斯托克宅邸进发试图寻找新的飞艇。在路上他们仅以毫厘之差躲过了鸣鸟的探查。伊丽莎白要布克承诺，决不让鸣鸟将自己带回去。布克深感不安，拒绝了这一要求。他进一步要伊丽莎白说出她在塔中到底遭遇了什么，伊丽莎白并没有明说如果鸣鸟将自己带走会发生什么，只是说那是一种堪比死亡的悲惨命运。

来到康斯托克宅门前时，两人发现要想进门，必须得有康斯托克夫人(Lady Comstock)的指纹作为验证。在了解到康斯托克夫人被葬于附近的公墓后，伊丽莎白决定进入墓室取得其手。布克虽不赞同，但无奈只能一同前往。

布克起初试着唤起伊丽莎白对康斯托克夫人的亲情来阻止她，但她对康斯托克夫人只有满心的愤怒，特别是在发现了康斯托克夫人正是让伊丽莎白被关进塔中的元凶后。布克最终妥协，他愿意自己去砍下康斯托克夫人的手，这样伊丽莎白就不用这么做了。在他们打开棺木时，康斯托克利用窃取自伊丽莎白的力量唤出了康斯托克夫人的鬼魂，一个已经成为女妖形态的鬼魂。布克和伊丽莎白在商业区追逐女妖的时候，也逐步发现了关于康斯托克夫人的真相。

通过遍布商业区的裂隙，布克了解到伊丽莎白并非康斯托克的孩子，而是他从另一个世界偷来的。多年前，鲁特斯制造出了一种可以撕开裂隙穿行于世界之间的机械，而借由这种机器康斯托克成为了真正的先知。其副作用导致康斯托克无法生育后代，而伊丽莎白就是被从别的世界带来作为康斯托克继承人的。康斯托克夫人则极为反感这种做法。她坚信这个孩子是康斯托克和罗莎琳德之间的私生女。担心其夫人会将此事公诸于众的康斯托克便将之暗杀，并嫁祸于她的女仆菲茨罗伊。稍后他又指示芬克前去暗杀罗伯特和罗莎琳德两人，并让其看起来如意外一般，而这一行为最终导致罗伯特和罗莎琳德变成了能够随意出现在所有时空的存在。

康斯托克宅邸
在击败了女妖进入康斯托克宅邸后，布克和伊丽莎白又遭到了鸣鸟的攻击。布克被抛进了临近建筑，在一阵眩晕后醒来，发现鸣鸟正要了结自己。布克因为重伤而无法行动，只能眼看着伊丽莎白提出自愿随鸣鸟回去，以此来交换它饶过布克。布克起身后不懈地追逐鸣鸟，试图救出伊丽莎白。在通往康斯托克宅邸的吊桥后．布克穿过了一片浓雾，迷雾之后的天气反常地寒冷．令人迷惑。在宅邸中布克找到的裂隙和留声记录表明，伊丽莎白在长达6个月的折磨和精神摧残中一直等待着布克前来。布克对这些内容深感震惊，他完全不知自己现在身处哪个世界，或是来到了多久以后。

当布克找到伊丽莎白时，她已经很大年纪了，而且如康斯托克所愿成为了合格的继承人。伊丽莎白向他展示了1984年受到哥伦比亚城攻击而化作一片火海的纽约城。布克说自己一直没有放弃寻找她，而伊丽莎白解释道，他的确如此，每一次都被鸣鸟所阻止。伊丽莎白给了布克一张纸片，让他交给年轻时候的自己，以将她从这种命运中拯救出来。之后她就打开了一条裂隙，将布克送回了他正常的宇宙。回到康斯托克宅邸的布克循着伊丽莎白的惨叫找到了她。此时卡姆斯托克手下的科学家们正在为伊丽莎白安装一个“枷锁”装置。如果她再有任何逆反举动，一道强大的脉冲震荡波将使她痛不欲生。更可怕的是，这个手术不会使用任何麻醉措施。布克摧毁了束缚着伊丽莎白力量的虹吸装置，伊丽莎白则杀掉了准备对自己进行手术的科学家们。布克小心地将伊丽莎白从手术装置上解了下来，同时也将未来伊丽莎白的信息给了她。伊丽莎白说起自己要杀了康斯托克的时候，布克没有允许，而是说自己打算这么做。

康斯托克与鸣岛
布克和伊丽莎白追着康斯托克来到了他的旗舰“先知之手”号上。在他们抵达目的地后，康斯托克对伊丽莎白说，发生在她身上的所有事都是因为布克的作为。康斯托克和伊丽莎白扭打起来， “先知”要布克说出伊丽莎白的小手指究竟是怎么了。在狂怒之下，布克拽过康斯托克，将他的头撞在洗礼台上，最终在洗礼池中淹死了他。而在这个过程中，布克确实想起了一些关于伊丽莎白小指的事情，但他将之归咎于康斯托克的栽赃。伊丽莎白问布克这究竟是什么意思，后者在茫然中无法给出答案。

布克和伊丽莎白发现要想彻底离开城市就只有通过裂隙，但岛上残存的虹吸装置阻止了伊丽莎白发挥能力。此时她明白了未来的自己传递回的信息，找到了控制鸣鸟的办法—一在乐器上奏出代表C、A、 G、E四个字符的音调。利用对鸣鸟的控制，两人击退了民众之声的攻击，摧毁了纪念塔岛的残余。

真相揭示
在失控的鸣乌开始攻击布克的时候，伊丽莎白将他们一起转移到了极乐城。鸣鸟在城市建筑外的海水中被水压摧毁。伊丽莎白此时已经可以打开通向所有世界的裂隙了，这些无穷无尽的世界都是因为布克的不同选择所造成的。同时伊丽莎白也告诉布克，康斯托克并没有死。在其他世界还依旧存活着。