关于张三丰内丹术思想之渊源，李涵虚《张三丰全集·派考记·道派》曾有这样的记载：
大道渊源，始于老子，一传尹文始，五传而至三丰先生。虽然，老子之所传亦甚多矣，其间杰出者，尹文始、王少阳。支分派别，各有传人。今特就文始而言之：文始传麻衣，麻衣传希夷，希夷传火龙，火龙传三丰。或以为隐仙派者，文始隐关令、隐太白、麻衣隐石堂、隐黄山，希夷隐太华，火龙隐终南，先生隐武当，此隐派之说也。夫神仙无不能隐，而此派更为高隐。孔子曰：“老子，其犹龙乎”，言其深隐莫测也，故又称“犹龙派”云。

按：老子之道，文始派最高，少阳派最大。少阳传正阳，正阳传纯阳，纯阳首传重阳，重阳传邱长春，开北派；纯阳又传刘海蟾，海蟾传张紫阳，开南派。
再按：文始一派至麻衣而传希夷；少阳一派，刘海蟾亦以丹法传希夷，两派于斯一汇。是三丰先生谓文始派也可，谓少阳派也亦可。

正宗大道，始于老子，一传尹文始。尹文始，即函谷关关令尹喜。老子过关，关令尹喜强为之著书，遂作《道德经》五千言，尹喜由此得道，这是老子的第一个传人。《玄门必读》曰：“尹喜真人，姓宓，字公文，号关尹喜，河南陕州灵宝县人。”尹喜真人，亦称文始真人。以文始真人传下来的这一派，亦文始派。

文始传麻衣，麻衣传希夷。麻衣者，何人也？知道的人可能不多，据我的一位弟子说，《道藏》里有麻衣道者的记载。《纯阳帝君神化妙通记》曰：“纯阳帝君，高尚其志，不事王侯，绰然方外，顿超物表，所以天下莫敢臣，侯王不能友。自别师后，密隐华峰羽谷四十余年，自唐末间，时人方知之。故指示李奇。奇寿百五十岁终焉。度诸仙百余人，隐显更名不一。五代时，又隐华山，号无家宫。至衣麻衣布袍，人呼为麻衣道者。以易理参同点化陈希夷。先生与燕国相刘玄英，即海蟾君也，皆师事之。”可见麻衣道者，即纯阳帝君吕洞宾也。

麻衣道者纯阳帝君传希夷。希夷即陈抟，字图南，号扶摇子，唐末五代时，普州崇龛（今四川安岳境内）人。在后唐清泰年间，曾隐居武当山九室岩。后移居华山云台。《宋史·陈抟传》说他“因服气辟谷，历二十余年，但每日饮酒数杯。”“每寝处，多百余日不起。”由此看来，陈抟不仅是睡仙，一睡就是百余日不起。而且，也可称是服气辟谷之鼻祖，辟谷二十余年，真令人惊叹！
希夷传火龙。火龙真人，姓郑，名思远，号小祝融。世称神医。火龙传张三丰。老君大道，一传文始，五传而至张三丰。故张三丰可谓文始派。

张三丰亦属少阳派。《玄门必读》载：“东华祖师王诚字玄甫，栗华子，系古仙东园公，于汉永寿元年（155年）乙未六月十五日降生，得太上降传大道，隐于昆仑山，复居五台山紫府洞天，自称少阳帝君。后居于终南山凝阳洞，以道授正阳祖师、王重阳祖师。潜修正位，辅立极大道帝君，十月十六日上升。法派曰少阳派。”凡少阳帝君王玄甫传下来的这一派，称为少阳派。少阳传正阳（钟离权），正阳传纯阳（吕洞宾），纯阳传海蟾（刘操），海蟾传希夷（陈图南），希夷传张三丰。张三丰成为少阳派第六代传人。如果按纯阳传希夷，希夷传三丰，那么张三丰应是少阳派第五代传人。

关于张三丰的内丹术思想，还来自于陈上阳。《道统源流》曰“陈上阳先生传张三丰，名君宝，字玄玄。元季辽东懿州人。好道善剑，与明太祖为友，在鸡足、武当等山开派。”陈上阳，名致虚，字观吾，号上阳子。江右庐陵（今江西吉安市）人。《续文献通考》说：陈上阳“遇青城老师亲传先天一气，坎月离日金丹之旨。”此南宗修炼之丹法也。陈上阳的内丹术思想与南宗有很深的渊源。他著的《金丹大要》说：“华阳玄甫、云房、洞宾授受以来，深山妙窟，代不乏人，其间道成而隐，但为身谋，不肯遗名于世者，岂胜道哉！复有存世传道，序传诗歌，或隐或显，宁具知乎？至于功高德重，尊居帝境，宰制劫运者，又唯备知。燕相海蟾受于纯阳，而得紫阳，以传杏林、紫贤、泥丸、海琼，接踵者至多。”陈上阳列出的这个丹道传授体系，正是南宗丹道传授的体系。他特别推崇南宗开山祖师张伯端。《金丹大要》说：“丹经妙诀，散满人间，唯紫阳《悟真篇》颇详，又得无名子诸公引而明之。”紫阳即张伯端。无名子即翁保光，翁保光得道于广益子刘永年，刘永年“即白龙洞道人，紫阳入室之徒也”（《金液还丹印证图·后叙》）。可见，陈上阳的内丹术思想，与张紫阳有着直接的关联。而陈上阳又传张三丰。张三丰亦属南宗一脉。

何谓南宗？《三馀赘笔》曰：“其南宗者，谓其东华少阳君得老聃之道，以授钟离权，权授唐进士吕岩、辽进士刘操，操授宋张伯端，伯端授石泰，泰授薛道光，道光授陈楠，楠授白玉蟾”。南宗一派实为少阳派。
按前文所述，张三丰的内丹术思想来源于三大派系。其一，张三丰是文始派。但文始派并无具体的修炼术传于世。文始派二传麻衣道者吕洞宾（吕岩、吕纯阳），五传而至张三丰。而麻衣道者吕洞宾正属南宗一脉，可见，张三丰也应属南宗。其二，张三丰是少阳派，而南宗正属少阳派，可见，张三丰应属南宗一脉。其三，陈上阳传张三丰，而陈上阳亦为南宗一脉，张三丰也应属南宗。

张三丰的内丹术思想，渊源于南宗。甚至可以说，直接来源于南宗。李远国《道教气功养生学》说：“明初武当三丰派的实际创始人，元明间著名道士张三丰，亦受南宗丹法影响。其传世之作最负盛名者《无根树丹词》，亦直接源自白玉蟾”。可见，张三丰应是白玉蟾的传人。南宗从王玄甫到白玉蟾，其间经历了九代，张三丰是南宗第十代传人。张三丰继承了南宗内丹术思想，开创武当派，流传至今。现在成都市青羊宫所传武当太乙功，实为南宗内丹术，乃南宗千古不传之长生术也。
可以说，南宗其主要代表人物，无一不长生。南宗一脉，始于老子。老子，姓李，名耳，字伯阳，谥曰聃，被奉为太上老君，乃道教之始祖也。楚国苦县（今河南邑县）历乡曲里人。任继愈《中国哲学史》说，老子约生于公元前580年（周简王六年）。老子传东华帝君王玄甫（生于公元155年6月15日），此时的老子，应是七百几十岁了。