1.阴阳布化，万物以生 《内观经》对宇宙万物的生起，其论述不像别的经典那样细致，仅有简略的概括。它指出，“天地构精，阴阳布化，万物以生。承其宿业，分灵道一。父母和合，人受其生”。除去“承其宿业，分灵道一”一语，显系从《系辞》而来。《内观经》把阴阳与道进行了区别，认为阴阳化生是事物存在的物质基础，而阴阳气化以道为存在运动变化的依据。“宿业”是指天地真父母与父母精血的偶然结合，才使人有了现实的生命。对于生命的孕育过程，渐次论述了人在母腹中从一月到十月成熟的阶段性。接着说，“太一帝君在头，曰泥丸君，总众神也，照生识神，人之魂也。司命处心，纳心源也。无英居左，制三魂也。白元居右，拘七魄也。桃孩住脐，保精根也。照诸百节，生百神也。所以周身神不空也”。作者认为，人体内的各脏器，均受大脑的控制，而各器官又彼此联系，共同构成人的生命存在。其中，心与脑的重要地位，为作者特别予以了强调。人通过与外部元气的沟通，使生命的机能得以延续发挥。“元气入鼻，灌泥丸也，所以神明形固安也。运动住止，关其心也，所以谓生有由然也”。人通过口鼻与外界交流，使生命得到滋养，生命活力才得到了表现。这里，还没有后世内丹学尚阳说的出现，依然坚持了老庄道家尚阴的传统观念。
2.心者，一身之主 依照《内观经》的认识，心在人的生命存在中居于核心地位，修道的核心是心灵的修持与净化。作者如是言，“心者，禁也，一身之主，禁制形神，使不邪也。心则神也，变化不测，无定形也，所以五脏藏五神也”。心在五脏中居于主宰的地位，但它必须与其它器官相匹配，发生知觉判断、心理意识等活动，而精神“无定形也”，说明精神不具有物质形态，心灵发生作用就是神，“其神也，非青非白，非大非小”。精神活动的神妙莫测，“变化莫测，混合阴阳。大包天地，细入毫芒。制之则正，放之则狂。清净则生，浊躁则亡。明照八表，暗迷一方”。清净是心灵的本然状态，而当心灵的本然状态发挥作用的时候，就可以产生“明照八表”的观照能力，否则就会“暗迷一方”，失去了心灵的理性自觉的本质作用。修道实践的要旨在于，“但能虚寂，生道自常。永保无为，其身则昌。世以无形，莫之能名。祸福吉凶，悉由之矣”。保持心灵的纯洁凝湛，是吉凶祸福之本，如果能够实现自我存在的本然状态，就可生命长存而智慧明觉。
《内观经》具有区分人的本来生命存在状态与现实活动状态的意识。其论述首先追溯人的存在本源，来自阴阳气化。其次，从心的生理功能，进一步论述心灵在人的存在中的地位。在对人的生理、心理属性进行说明时，对存在论问题与意义论问题进行了适当的界定。最后指出，修道实践就在于保持心灵的虚寂本性。人不能实现“生道自常”的解脱目标，根源在于，虽然“始生之时，神源清净，湛然无为”，可是随着生命的成长，“既受纳有形，形染六情”，从此迷失了自我的本性。如果要回归原本的清净，当“内观己身，澄其心也”。由于作者说明了心的决定意义，所提出的“内观己身，澄其心也”的解脱方法，就有了坚实的基础。《内观经》真正具有理论时代性的内容，是它对心、性、情、命等的分析概括，这一论述产生了广泛的影响。