二周目攻略
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走邪线的玩家请先回老家挑战格斗道馆拿第七徽章。
现在先去伊弗联盟左边的命运塔，在里面见到了混沌龙，混沌龙让主角去阴影峡谷见骑拉帝纳。来到已净化的阴影峡谷，见到了骑拉帝纳，骑拉帝纳对主角道歉，这时可以根据你自己的选择（一般线）或者以前的剧情（正邪线）成为雪米或骑拉帝纳的守护训练师。

现在回去命运塔找混沌龙，它说觉得现在已经和平多了。现在去下面和JAYSON对话，它说混沌龙是不能背不住ode，因为它维持着世界的平衡，并问你想不想拥有混沌龙这只精灵，选yes混沌龙入手（对剧情无影响）。再和他说话，他会问你买不买SHINY GEM，这个物体用在骑拉帝纳、雪米和某只精灵（先卖个关子）可以使它改变形态。

这时可以去LEON EMPIRE内找公主挑战（超能系），胜利后得到第八徽章，智慧徽章。现在可以去挑战伊弗联盟，外面一群训练师可以反复刷级，联盟内部是17个天王（等级较高，85J以上），不限顺序，途中只可以找护士补三次血。挑战完17天王后，可以上楼挑战冠军，冠军竟然是JIMMY，突然间冥狱龙控制了JIMMY，A掉。这时冥狱龙逃掉并声称自己对人类的报复是不会停止的。冥狱龙离开后JIMMY也离开了。

进行传导

二周目结束（好短的二周目）

三周目攻略
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先回到伊弗联盟和看门的对话，得到代表冠军的伊弗徽章。

现在来到TWILIGHT TOWN，和在洞口的J.B.Crosell对话。进入洞里发现冥狱龙，它把J.B.Crosell拉下地底。跟下去在里面，A掉（100J，不可捕捉，捕捉率0），冥狱龙死去（这时你会得到一只5J的冥狱龙）。

现在去MOUNT KRYSTAL山顶，先和NICOLAS对话，他说要回去城都地区，离开。再和天堂龙对话，得知它大限将至，对话后天堂龙也死去了（这是你会得到一只5J的天堂龙）。现在在SILKWIND TOWN上方与将要离开的NICOLAS对话，得到HM07。

来到BREEZE ISLAND，见到生命龙和APRIL，与生命龙对话，它告诉主角作者他所处的世界是一个假的世界，不应存在的世界。而生命龙有时候会变成另一个存在——死亡龙，由于死亡不应该主宰生命，所以混沌龙把他流放到这。它请求主角打败死亡龙，连选2次yes，开始双打生命龙和死亡龙。战胜后生命龙死亡，但APRIL牺牲自己就回生命龙，这时主角可以二选一要生命龙还是死亡龙（5J）。

最后，去LEON EMPIRE见裂空座，他说他也快归西了，最后想和主角来场对战，A掉（得到5J裂空座）。

去命运塔去见混沌龙，它说在主角截的时候它曾想消除这个世界，但由于生命龙说主角会帮到它，它就犹豫了。混沌龙告诉命运红宝石能满足一个人任何的愿望，并让主角去收集命运红宝石的碎片。它交给主角其中一块碎片并叫他找到其他碎片后许愿使这个不应存在的世界变得稳定。

寻找命运红宝石碎片之旅开始。先到伊弗联盟找JOSEPH（前提是你已经见过他，请看神兽捕捉中关于阴阳球的捕捉剧情），他会给你一个碎片。

现在去BOUQUET FIELD，进入山洞，在某个出口出去见到凯路迪欧，A掉或者捕捉它（20J），得到一块红宝石碎片。

这时主角来到了时间的边缘，每往前走几步命运红宝石就会出来阻止你，每次战胜都会看到配角、神兽们对主角的鼓励。

PS:在游戏完结后去命运塔，点不同柱子可以发生不同的战斗，对大家的剧情了解多多少少都点帮助。

三周目完结，游戏完结

支线任务
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虽然说是支线任务，但有几个和最后的主线剧情是相关的，不完成就通不了关。（一共6个，作者说支线5和7他移除了）
1.ANOTHER FRIEND：GUARDIA TOWN某屋子找某女性接任务，在GREEN LEAF帮她找一个物品，完成任务送黑白三猴之一。

2.RINTAH'S SYBOL：RINTAH TOWN中与某老人对话接任务，给他看以前RINTAH TOWN馆主的徽章。当你从JOSEPH那拿到一块红宝石碎片后，再和他对话，他会给你RINTAH TOWN的徽章，拿回去给老头看，得到学习装置。

4.BEHIND THE ICE：HIGH POINT TOWN与房间内某绅士对话触任务，他要你发现WHITE PATH里被雪覆盖的山洞。当开始手机红宝石碎片任务开始时，WHITE PATH出现一山洞，A掉或捕捉了里面的冰晶龙后得到一块红宝石碎片，回去和绅士对话完成任务，得到不化冰。

6.BLITZ's REQUEST：去护林员基地睇下见BLITZ，他会叫你帮忙去送信。在RAINBOW PATH坐船，与船边的少女对话，得到红宝石碎片并完成任务。

剩余神兽捕捉
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所有神兽（除一周目三只二级神和二周目的骑拉帝纳或雪米和混沌龙）都是三周目开始才能进行捕捉，其中部分已在三周目和支线任务中提及。这里补充下未提及的神兽捕捉。
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无极豚（50J）
三周目开始可捉。在BREEZE ISLAND的地球团基地潜水艇靠岸处，到达触发剧情。

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凤凰（70J）
三周目开始可捉。在GREEN LEAF穿过某处山洞，来到ILEX FOREST，在尽头山丘上捕捉。需要碎岩、冲浪、闪光。

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月神猫（5J）
三周目开始可捉。先去护林员基地找LEANA对话，她叫你去VEXTRA FOREST调查，在森林发现有一个新入口。进入看到RICHARD和月神猫，连A3次（等级较高，注意）。再上前A掉月神猫（100J，不可捕捉，捕捉率0），入手5J月神猫。

美梦神
对月神猫使用SHINY GEM变换形态。

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阴阳球（5J）
在TWILIGHT PATH进山洞，穿过山洞见到某男和阴阳球。选择不离开，A掉他。他说他是JOSEPH，伊弗地区的前冠军，他为了保护阴阳球来到这里。在和他对话一次，选yes后点阴阳球。战胜它后（100J，不可捕捉，捕捉率0），加入。JOSEPH返回联盟。需要碎岩。

小路基亚（5J）
完成NICOLAS回成都事件后，冲浪到WHIRL ISLANDS（漩涡岛），在里面找到NICOLAS和他奶奶。和他奶奶对话得到小路基亚（亲密度进化路基亚）。需要冲浪、闪光。

加百列狮（30J）
三周目一开始就能触发剧情，但要入手要在NICOLAS回成都地区事件后。在OCEANSHINE CITY触发加百列狮离开CLAIRE的事件，在DUSK PATH使用攀瀑发现有个洞口，在山洞分支处右走。离开山洞发现一女性DIANA，触发剧情，得知加百列狮体内蕴含着另一灵魂——奈法利安（黑加百列狮），A掉DIANA。萨满出现，告诉主角DIANA是她姐，也是加百列狮，或者说奈法利安以前的守护训练师。

这时开始跑地图了，按顺序在CORAL SEA，FRUITS' BASKET，HEVAH ACADEMY，DUSK PATH，ICE'S EDGE PATH， CURRENT PATH，GUARDIA PATH，OCEANIA SEA打败它（均捕捉率0）

现在回去见到DIANA的山洞，在山顶见到加百列狮，进入捕捉（百分之50几率闪光）。