鲸鲨栖息在热带与温带海域,大约分布在南北纬30度的范围内,也会有迁移行为[3]。鲸鲨每年春天会迁移到西澳大利亚中部的大陆棚海域,这里的宁歌路珊瑚礁(Ningaloo Reef)为鲸鲨提供了丰富的食物来源(浮游生物)。鲸鲨以浮游生物为主食,它们会在一些海域进行季节性的觅食活动,例如西澳大利亚宁歌路珊瑚礁、洪都拉斯、菲律宾董索与八打雁(Batangas)、坦桑尼亚奔巴岛、马菲亚岛与桑吉巴、印度大卡吉盐沼地(Great Rann of Kutch)、墨西哥尤卡坦州穆赫雷斯岛及荷布斯岛、马达加斯加贝岛、印度尼西亚乌戎库隆国家公园等地,以色列埃拉特也有非常少数的鲸鲨聚集。