于西南太平洋(WSP) , 澳洲大堡礁中部及北部曾有多达181个有关小须鲸的目击记录 , 这些目击记录大多是发生在南半球冬季(五月至九月), 其中有多达79.5%的目击记录发生在六月至七月 , 这些小须鲸可能和在澳洲及新西兰南部的南极水域一带的小须鲸族群有关 , 这些发现被认为和南北季节性移动一致的。
澳洲大堡礁一带的小须鲸侏儒个体

在基因分析上显示南半球的小须鲸族群都存有基因变异 , mtDNA的测试显示南半球的小须鲸存有很深的种群隔离 , 从单体型分析显示西南大西洋(WSA)和西南太平洋(WSP)小须鲸族群已明显属于两个不同的分化枝 , 遗传分歧程度和北太平洋及北大西洋的小须鲸的相似 。
近来有专家认为小须鲸于巴西及智利巴塔哥尼亚之间的低纬度水域一带是有迁徒联系 , 它们于南极西部高纬度海域进食。尽管动植物种类史的分析并不适合于追踪个体迁移或族群结构 , 但是巴西 , 智利巴塔哥尼亚及南极半岛的小须鲸族群都存有很密切的关系。于西南太平洋(WSP)种群也存有类似的情形 , 新西兰及汤加群岛的小须鲸族群也存有密切的关系 , 这些小须鲸个体和在相似纬度下的南极海域小须鲸也有密切的关系。

从分析上显示西南大西洋(WSA)和西南太平洋(WSP)小须鲸族群为不同的进化的重要单位 , 两地的小须鲸族群有各自的形态 。此外从mtDNA研究显示大西洋南部及北部的小须鲸有着共同先祖 , 关系上和西南太平洋(WSP)的小须鲸族群遥远。以上的发现研究显示南半球的小须鲸都属同一个亚种 , 但是北大西洋的小须鲸则属另一个不同亚种。