金鱼的种种颜色，主要是由于真皮层中许多有色素皮肤细胞枣色素细胞所产生。金鱼的颜色成分只有3种：黑色色素细胞、橙黄色色素细胞和淡蓝色的反光组织。所有的这些成分都存在于野生鲫鱼中。家养金鱼鲜艳多变的体色，这只不过是这3种成分的重新组合分布，强度、密度的变化，或消失了其中一个、两个或三个成分而形成的。
      有些同种鱼类的不同个体间具有不同的色彩。有些鱼类同一个体的一色，在一定的范围内随着背景的改变而发生变化。这是鱼类对生存环境的特殊适应。这种变化，随着物种的不同，变色的能力、速度会有所不同。
      会变色的鱼类特别多，金鱼是其中一种，变色主要受神经系统和内分泌系统控制，大多数对颜色的感应主要依靠头部神经系统。主要原因是为了适应环境色彩，同时还有其他因素。比如在受电光照射后，就会把一定的颜色和斑纹显示出来。当鱼受伤、生病或水中缺氧、水质变差时，鱼的体色会变暗，失去光泽。
头形的变异
     我国各地饲养者把头形分为虎头、狮头、鹅头、高头、帽子和蛤蟆头。在这些头形中，有的是同一类型，在各地有着不同的名称。如北京饲养者称为虎头的，在南方称为狮头;在北京称为帽子的，在南方称为高头或鹅头。在这里根据陈桢教授的命名，把头形区分为平头、鹅头和狮头3种类型。
      1、平头型：其头部皮肤是薄而平滑的，称为平头型。有窄平头和宽平头之分。
      2、鹅头型：头顶上的肉瘤厚厚凸起，而两侧鳃盖上则是薄而平滑的。
      3、狮头型：头顶和两侧鳃盖上的肉瘤都是厚厚凸起，发达时甚至能把眼睛遮住。
眼睛的变异
     可分为正常眼、龙眼、朝天眼和水泡眼。
      1、正常眼：与野生型鲫鱼的眼睛一样大小者称为正常眼。
      2、龙眼：眼球过分膨大，并部分地突出于眼眶之外，这种眼称为龙眼。
      3、朝天眼：朝天眼与龙眼相似，都比正常眼大，眼球也部分地突出于眼眶之外，所不同的是朝天眼的瞳孔向上转了90度而朝向天。还有一种在朝天眼的外侧带有一个半透明的大小泡，这种眼称为朝天泡眼。
      4、水泡眼：这种眼的眼眶与龙眼一样大，但眼球却同正常眼的一样小，眼睛的外侧有一半透明的大小泡，这种眼称为水泡眼。还有一种与水泡眼相似，只是眼眶中半透明的水泡较小，在眼眶的腹部只形成一个小突起，从表面上看很像蛙的头形，所以称为蛙头，也有人称为蛤蟆头。
      其实，生物的种类并不是一成不变的。它从一个形状简单的类型可以逐渐进化成多种多样的形态。