进行南阳恶性小汗腺螺旋腺瘤基因检测，首先需要准备以下手续：
1. 医学诊断证明：需提供由正规医疗机构出具的恶性小汗腺螺旋腺瘤的诊断证明，以确认检测的必要性。
2. 身份证明：提供患者的有效身份证件，如身份证、护照等，确保个人信息准确无误。
3. 病理组织样本：需提供患者的病理组织样本，通常由医院进行取样并妥善保存，确保样本的完整性和新鲜度。
4. 填写检测申请表：填写基因检测申请表，详细记录患者的个人信息、病史及家族史等相关信息。
5. 签署知情同意书：患者或法定监护人需签署知情同意书，明确了解检测的目的、过程及可能的风险。
6. 支付检测费用：根据检测项目的收费标准，完成费用支付手续。
完成以上手续后，即可将相关材料提交至检测机构，等待样本检测及报告出具。建议提前咨询检测机构，了解具体要求和流程，确保检测顺利进行。