1. 化学化工能源材料领域：
固体表面物理化学国家重点实验室（待重组）
电子化学品国家工程研究中心（待重组）
嘉庚实验室（30+亿，争创国家实验室福建基地）
智慧储能大科学装置（6.75亿，建设中）
高性能陶瓷纤维教育部重点实验室（B类）
谱学分析与仪器教育部重点实验室
电化学技术教育部工程研究中心
2. 海洋生态环境领域：
海洋负排放国际大科学计划（127亿，建设中）
近海海洋环境科学国家重点实验室（待重组）
海水养殖生物育种全国重点实验室（已重组）
福建台湾海峡海洋生态系统野外科学观测研究站
海洋省创新实验室（15+亿，筹建中）
滨海湿地生态系统教育部重点实验室
3. 生物医药领域：
细胞应激生物学国家重点实验室（待重组）
分子疫苗学和分子诊断学国家重点实验室（待重组）
传染病疫苗研发全国重点实验室（已重组）
国家医学攻关产教融合创新平台（建设中）
翔安省创新实验室（30+亿，建设中）
分子诊断教育部工程研究中心
疫苗与分子诊断关键核心技术集成攻关大平台
传染性疾病检测技术研究与评价国家药监局重点实验室
4. 信息技术领域：
微纳器件与先进封装联合实验室（待建设）
国家集成电路产教融合创新平台（已建成）
水声通信与海洋信息技术教育部重点实验室
多媒体可信感知与高效计算教育部重点实验室
微纳光电子材料与器件教育部工程研究中心
5. 航宇机械领域：
空天深海极端环境大科学装置（筹建中）
太行国家实验室网络单位
国际先进技术应用推进中心（策划中）
6.人文社科领域：
计量经济学教育部重点实验室
闽台非遗文化数字化保护与智能处理文旅部重室