问题1: 因为灵山理论上也在天庭的管辖范围内。
玉帝统一三界,这不是夸张,是他本身的指责就是这样的,包括大闹天宫时,如来说的也是 听玉帝调令而来。
问题2: 为什么要对大圣赶尽杀绝。
我个人解读有两种,一种是派系道路之争,不允许孙悟空有中立立场,你只能服从或者死,因为你一个中立逍遥的立场出来,成为表率,天庭日后管理就会有更多“反贼”。
另一种是 大圣真的缴了天上的买卖,因为序章故事老猴子说的,老猴子我觉得善恶不明,所以他的故事有可能真假存疑。
问题3:幕后黑手是谁:大概率玉帝、小概率如来 或太上老君。
至于NPC为什么对天命人客客气气,我的猜测是,因为天命人的动向被天庭监视,如果意不完整(普通结局)猴子就会带上金箍复活,对天庭来说他们的目的也就达到了,领孙悟空成为他们的傀儡打手。
但二郎神在天庭在弥勒的帮助下,隐藏了隐藏了孙悟空的记忆,令身为天命人的(真意)能完美觉醒,这是超出天庭预料外的。