齐齐哈尔工程学院具有独特的办学特色。其创造了“混合所有制办学”和“院校委托管理”的范例,是全国首家从国企分离开启“公转民”办学体制改革且具有行政级别和事业单位编制的民办高校。学校始终坚持社会主义办学方向,贯彻党的教育方针,坚持公益性非营利办学和应用型人才培养,秉持“以学生为中心”理念,实施全员“生涯导师制”,确立“党建领引三全育人,党政合力齐抓落地”工作方针。还探索出“政校企合作、产学研融合、教学做合一”办学模式,依托产业学院,以服务岗位需求和提高职业能力为导向,探索建立“护理类”“装备制造类”和“建筑类”校外课堂,拓展育人时空,并开发了“四真三化”(FT)课程建设。