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质粒重组构建 反向PCR线性化载体

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大神们帮忙看看吧 最近在构建重组质粒 采用的是同源重组的方法 载体线性化方法采用反向PCR 插入片段扩增时引物带上同源臂
1. 这是我设计的反向引物

2.这是我设计的扩增目的基因的引物


3.这是我重组后的测序结果

问题就是目的片段完全没有连接上去,而是插入了一些反向PCR 引物位置的小片段,我个人感觉应该是载体线性化过程出现了问题,但是线性化跑胶条带特异性又很好,没有杂带,如下图:

所以请问各位大神有遇到过这种情况吗,是真不知道什么原因导致的。
我个人猜测是不是我反向PCR引物设计的问题,正反向引物靠得太近了,而且重组后的片段也都是引物那个位置的片段,所以不知道是不是这个原因,其他的真想不出来了,求解。


IP属地:广东1楼2024-06-05 11:00回复
    上reddit问试试,那边大佬比较多,我都是去那边问的


    IP属地:美国来自iPhone客户端2楼2024-07-05 21:12
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      解决了么吧主,我现在也遇到这种问题,我想问下是不是PCR引物太近了的原因么,不能这样扩么


      IP属地:重庆来自Android客户端3楼2024-08-20 15:15
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