为解决地铁工程建设档案归档移交中的问题，主要应做好以下几个方面的工作。
第一，重视竣工档案移交问题，提高自身意识。在竣工档案的整理移交工作中最重要的就是领导重视，自上而下层层带动，有制度有计划的做好竣工档案移交工作。在管理制度中要统一纳入到工程人员责任制上，实施统一集中管理。档案工作人员要从根本上认识到竣工档案移交的重要性。从宏观上来说档案工作是记录单位的施工历史，真实客观地描述工程的过程，微观上来说工程档案记载着工程的设计、规划、施工和使用的基本情况，记载着地铁线路的基本布局。这对于后来的地铁建设有着很大的借鉴意义，对于地铁的发展意义重大，这样也可以使其他的地铁工程加快速度，提高设计质量以及经济效益。
第二，加强竣工工程档案工作的宣传力度、教育力度，让所有人感受到竣工档案的重要性和必要性。竣工档案归口管理部门应适时的搞一些专项学习活动，让档案管理人员能提高专业技能，让所有的参建单位工作人员了解档案工作的内容，关注档案工作。以使大家积极配合，营造一个良好的氛围，减轻档案工作的难度，在工程结束后，能顺利地将竣工档案通过审核进行移交。
第三，制定档案归档工作的奖罚制度，调动工作人员的积极性。要使竣工档案达到完整、准确、系统，还应从奖罚制度入手，坚决执行归档制度，做到有规可循将档案的收集、积累、整理、移交等纳入到考核标准中，工作好的人员应给与表扬或者奖励，工作不认真的人员给予适时调整，给予批评或者处分等，从而保证竣工档案完备、准确。