在魔禁中，相位和魔法是两个重要概念。河马对于相位的解释是类比于滤镜之类的事物，将这层滤镜上的规则应用到现实世界上，就产生了各种神奇的现象，魔法和奇迹就如此出现了。施展魔法需要人的身体精炼魔力。我猜想，在魔禁的设定里，魔法的底层逻辑是，人的呼吸和冥想能精炼出魔力，同时，这个精炼魔力的过程将人和世界从物质上和精神上联系起来。接着，魔法师通过具体的冥想、仪式、祈祷、象征等方式构建出一个相位的概念，再用魔力使其成形，覆盖到现实世界上去。
然而，基于人的愿望生成的相位，和现实世界本身是存在矛盾的，否则魔法师也不需要借助魔法这种神秘的力量来实现自己的愿望了。这就导致相位和原初世界的缝合出现了摩擦，要将不合理的事情强行合理起来，需要付出其他更多的代价，这就是相位的火花，相位火花从抽象世界上坠落，也就化为了命运的不幸和悲剧。同时，相位的规律的运转，需要魔力来维持，因为魔力是人与世界的联系，只有这样，相位才会在世界上不断发挥作用，而不被“停机”或被世界本身排除。达人魔法师追求的基础，实则就是用最简单的方法来构筑最复杂的相位的过程。因为在魔法兴起之初，凡人的庞大愿望只能寄托在一些简单的仪式之中。达人的实力足以运用简单的仪式建构能使庞大愿望实现和满足的相位，以此向众人展现奇迹。
魔神是具备了海量的知识，可以随心所欲创造、修改、毁灭相位的强者，但他们也有局限性。他们的能力源于他们的知识，对于知识以外的力量，他们是无能为力的。另外，他们的知识令得他们用简单的方法构筑简单的相位，用复杂的方法建构复杂的相位。例如只眼需要制造主神之枪才能使自己的魔法完全发挥出来，而不陷入百分之五十失败的境地。这也体现了魔神们缺少用简单的联系唤起恢弘奇迹的知识和经验。这就是魔神不如达人的地方。
回到魔禁上来，经过上面的讨论，我们看到魔法和相位的概念本身就是会带来灾难的。这也就给我们亲爱的主角，上条当麻创造了发挥的舞台。承受了经年的不幸而决定要遵循自己内心对他人的不幸伸出援手，勇往直前的少年，注定会在魔法引发的命运洪流中不断挣扎。我们可以借此来猜想剧情的大致走向。我想，魔法禁书目录的结局，应当是要消灭魔法的。旧约、新约、创约的故事，给我们展现了魔法师的行为、魔法的宏伟景象、以及魔法师最本质的愿望。创约目前为止的超绝者篇，不就是超绝者们追求治愈世界的终极灵药的故事么？当然，他们最后失败了，而这个失败是必然的。因为想要通过魔法这一摧残磨损世界的技艺来施展治愈世界的灵药，是自相矛盾的事情。
上条当麻在战斗的过程中，结识了很多人，科学侧的超能力者、科学侧的统领、魔法侧的魔法师、魔法师的杰出魔法师魔神、魔法师的另类存在超绝者、魔法师的达人……假如这些人的目的都是出于善意的，那么他们终究会需要一个治愈世界的万灵药的，我们把这个万灵药暂且看作是魔禁的终极问题。
可以看到，条的相识之人都拥有不同的身份，而具有一个相同的终极目的，那么魔禁的终极问题，应该就是彻底消灭命运的悲剧，开发真正的万灵药，而这个万灵药的技术基础不能是魔法。在追求万灵药的过程中，或在这之前，魔法会被彻底消灭，或被科技完全取代，而消逝的魔法技术，则被茵蒂克丝记录在脑海里，仅仅作为一个历史的见证。这也可以点题魔法禁书目录。
结局要怎么办呢？如果按照一些王道、甚至是烂俗的rpg游戏发展，这时候已经可以两手一摊，“我们要相信人类自己的力量，要靠自己的双手创造美好的明天”了，但这并不应当是魔禁的结局。因为上条当麻已经不止一次演示过如何靠自己的双手争取幸福了，他仅凭幻想杀手和身手，以及自己的知识和一腔热情，拯救了不计其数的人物。但这种热情和觉悟在一次次的困难压迫下，依然显得很渺小。最终，仍然需要结合所有势力的力量，为终极问题带来一个“具体的抽象解”，我猜测这个抽象解的出现，必然要由科学侧、用科技来完成。