微生物属于佛教所说的不杀生之列，杀生是难免的，佛教提倡不杀生，是尽力而为。
“所有一切众生之类，若卵生、若胎生、若湿生、若化生、若有色、若无色、若有想、若无想、若非有想非无想，我皆令入无余涅盘而灭度之。”
根据金刚经这段话，微生物应属于湿生和化生之类。
佛教的不杀生尤其是针对于人类，即不杀人，其次针对于与人较亲近的动物，佛教也称之为“旁生”（和人相似，只是生偏了，故名旁生。）因为佛法出于人间，人是最佳的佛法受众，佛教也称之为当机者。
佛法不是反人类的，佛法是对人性的提升和超越。因为人性是有缺陷的，比如：我执（佛教术语，认为有“我”的存在，故而一切以“我”为中心），因为我执，所以人性是自私的。佛法是人类的众法门的所归。
有人说，素菜也有生命，吃素算不算杀生呢？根据圣严法师的解释，他把生命分为几个层次，最高级的是人；其次是猪马牛羊之类，它们有记忆，也有简单的思维；至于病毒和细菌之类是属于非常低级的生物，它们只有细胞而没有神经，不懂得苦乐，所以也就不存在杀生的问题。
所以，如果我们感染病毒后，要赶紧治疗才是。