牡丹的修剪包括定股拿芽，摘蕾护胎是牡丹养护过程中的重要环节，不仅关系到牡丹的观赏效果而且关系到牡丹的健壮长寿。
牡丹修剪目的是保持根杆平衡，通风透光，养分集中，生长旺盛，花大色艳，株型美观。
第一拿股:就是定干，确定枝条数以维持树形。根据品种长势，一般留5-8股，达到高低一致，分布匀称。春分到清明土芽5-10厘米的时候定干最佳。
第二拿芽:就是剪去赘芽。一般长势强的牡丹一枝留2-3芽，长势弱的牡丹一枝留1芽。剪去内向枝、交叉枝、重叠枝，病枯枝，集中养分花大色艳，节省养分促进根部生长。所谓“剔嫩芽，精脉聚于老干必健壮，气聚则花必巨丽”。否则开花特别小，且老枝日行萎缩根耗而衰。本人建议春秋各进行一次拿芽。
第三摘蕾:一枝生一花，则花大而艳，若一枝数花，花小而碍次年开花，甚至影响整株的生长。本人认为摘蕾是弱株复壮的最好方法，3-5年健壮牡丹开3-5朵比开8-9朵更具有观赏效果。
第四护胎:“胎”是指花芽内养分的储存。表现为花芽饱满，髓小木质化程度高。养牡丹护胎很重要，怎么护胎呢？开花前后土壤必须补充肥料，开花后避免结籽等。古书记载牡丹受灾害落叶太早，胎将萌动时需薄娟敷胎，否则来年无花，甚至根耗而衰。