两者最终结果没区别，区别在于中间流程。
检察院绝对不起诉，走的的刑事案件流程，这个复杂时间也长（多次笔录、拍照、录音、录像、采集指纹、红膜、血液、取保、银行缴纳保金、作绝对不起诉决定、退保...），公安直接撤案当然简单了。