要分析窗口期，首先就得弄明白什么是窗口期，窗口期是指从病毒进入身体到能检测出抗体的这段时间。可见，窗口期是根据检测方法来说的。
目前hiv的检测方法可以分为两类，初筛检测和确诊检测，初筛包括酶免 发光 金标等等以测igg/igm/p24抗原为主的检测方法。确诊检测是指检测hiv特异性条带的方法，我国主要用的是wb蛋白免疫印迹法，具体内容本吧已经有过很多科普贴，不多做赘述，下来就说说不同级别检测方法的区别和临床检测程序中的关系。
初筛旨在更早的发现问题，因而初筛检测的检测目标是发现出现的比较早的艾滋igm/igg抗体，igm/igg抗体在人感染最初的二到四周内相继出现并快速增多，igg抗体更是终生存在于检测线以上。目前的初筛检测以三代为主（四代还没有做到完全普及），其灵敏度高到三周左右就可以测到感染者体内的igg/igm抗体，这里说的都是针对绝大多数人的平均时间，（极少一部分人可能更）早，两周就测出来了，有的人会晚点可能四周，为了保险，大多数专家针对初筛采取了科学又保守的态度，六周！
四代试剂在igm/igg抗体水平上增加了p24抗原，所以窗口期又有所减短，最早平均2周能测，4周排除，由于过了4周，抗原逐渐减少，6周后抗原减少（并不会消失），所以过了六周检测四代跟三代是没有区别的（由于检测技术分布的不平衡，绝大多数地方只有三代检测，所以统一建议满六周测，就不用纠结三代四代了）。
以上是四六周窗口期的来源。接着来说说大家关心的三个月
三个月的窗口期主要有两个来源，第一针对早期的酶免一二代检测试剂，灵敏度低，平均窗口期都45天，临床应用保守点三个月。一二代试剂早已绝迹，无需再考虑
第二个原因才是主因，那就是以wb确诊检测为准的窗口期。wb蛋白印迹法检测hiv特异性条带，标准极其严格，很多科普帖都有详细赘述，此处不多做解释，就主要说说疾控和普通医院为什么说三个月吧
对于wb确诊检测来说，真正的满足确诊标准即wb检测阳才叫抗体转阳，在我国，确诊标准是hiv特异性条带满足一定数量，感染hiv后条带出全gp160、gp120、p66、p55、p51、gp41、p31、p24、p17，而满足确诊标准并不需出现全部条带，只要满足确诊必须的三条带即可。（p24 gp160 gp160）
条带的出现是跟个人体质有着莫大的关系的，一般来说，绝大多数人感染3个月左右，就都满足了确诊标准，所以疾控为了准确度和不浪费资源，统一以三个月作为确诊检测窗口期，既符合科学规律也符合临床实践
也有人比较早就满足，我曾经接触的一个确诊者，四周去医院查就已经四家医院初筛阳，上报疾控后因为不够三个月，所以疾控不做确诊，要求满三个月再来。他在六周时实在忍不住就换了一家疾控，谎报已满三个月，疾控直接送到省疾控去做确诊，第七周就已经确诊，到第八周就已经用药了。这是wb确诊早于三个月的例子，有早的也有晚的
在wb确诊实验中，即使用初筛检测阳一百次，而不能满足确诊检测条带所需的标准的话，都会被判定为 抗体待确定，在目前的临床检测中，如果条带不能满足确诊标准，会判为抗体待确定，要求随访（一个月后随访条带还是不确定 会在过一个月随访 三次随，如果到时条带依然没有进展）按照之前的标准是可以判定为没有感染艾滋的，也就是出和wb检测的阴单。而如果条带满足了确诊标准，那么就判定为wb检测阳，即确诊，这也就是所谓的三个月转阳。当然，目前估计很少这么久了，因为有了直接的病毒核酸检测等其他辅助。现在有问题上报一周到两周就能出结果
以上就是三个月窗口期的来源。
临床检测程序中初筛确诊的关系，上文说过，疾控为了准确度和节省资源，不管初筛确诊都统一要求三个月，所以一下文字提到的时间，统一是疾控三个月为主，医院都是遵从疾控的说法，因为他们收到的是统一的国家命令。但以目前初筛检测的灵敏度，六周足以
以医院检测为例，初筛阴，判为阴，即没感染。
初筛阳，会复查（依然是初筛方法，但要求不同方法同时检测），复查阴，判为阴，没感染（之前的检测阳为假阳）
初筛阳，复查阳，上报疾控，疾控再做复查，复查阴判为没感染，阳，上报省疾控做确诊。一般此时确诊只是时间问题，但也有极少数翻盘的。。
由此可见，初筛跟wb检测的关系，窗口期后，初筛阳，复查阳，才会去做wb。窗口期后初筛阴，是根本不做wb检测的
也就是说，以现在的检测方法来说，初筛六周阴，即没感染，根本遇不到后面的三个月窗口期，只有六周阳，复查阳，才会有可能在3个月做wb阳。
故而，不要再纠结什么三个月窗口期，那是以wb确诊检测为标准的，所谓的三个月指的是确诊，而不是初筛才阳。所以三个月窗口期是不适合目前的初筛检测的。再说一遍，很多疾控和普通医院的大夫笼统的回答三个月，是以确诊标准来回答的，而非初筛标准。以目前的初筛技术。四代四周 三代六周阴就可以排除了（已经很保守的时间了）