明军攻克今阿拉善额济纳一带，一直攻到哈密，又攻陷今内蒙古翁牛特旗，进至西拉木伦河，迫使元庭和沿边军民北移驻牧。在云南，明廷30万大军出击，元梁王兵败自杀，明统一云南。在东北，明军于1384年控制了女真地区，迫使高丽（今朝鲜，一直与元友好）彻底臣服，1387年进军东北，元军民20万人投降，辽阳行省丧失。最后，明军发动了对元庭的攻击，在捕鱼儿海（今贝尔湖）突袭元庭，另有数万军民被俘。1388年10月，北元后主脱古思帖木儿汗在漠北土拉河遭到西部蒙古瓦剌贵族支持的阿里不哥（忽必烈之弟）的后王也速迭儿的袭击，脱古思帖木儿被杀