滴了两个多月的眼药水，会不会起什么副作用？

我得了很严重的结膜炎，具体是哪种我也不太清楚。但耳前淋巴结肿大，眼睛还被感染得长了些细小白点，到现在两个多月了，视力还没恢复过来。每次去检查，医生都说有少有少，可还是觉得很慢。而且本来是左眼严重，快好了，就右眼严重起来了，该死的结膜炎，快折磨死我了。
很担心这样滴药，没事也得给滴出事来吧？