1.2B是在与9S逃亡的过程里被感染的寄叶队员战斗时中病毒的，注意最后那几个emp攻击2B挨了那个以后机体就出问题。寄叶全灭的计划与司令官无关她也只是棋子之一。
2.当时2B自己中病毒的不确定9S的位置，2B自己不一定能坚持到找到他。S型确实有解除别人病毒的能力，但给自己解有概率解不干净，设定里逻辑病毒会自我进化学习S型的解毒逻辑产生抗体。
3.她有很多名字红衣少女，term α／β，N2真实身份是机械生命网络聚合体，简单来说就是机械生命的真BOSS
4.那是前作《尼尔人工生命》的故事，简单来说就是迪瓦拉和波波拉没看住前作主角，让他杀死了人类的救世主导致了人类灭亡
5.A2帮9S转移病毒那是C结局，但从官方小说和日后谈朗读剧官方好像更偏向D结局接E结局。D结局是9S和A2同归于尽

其实最好再补一下前传广播剧，里头有很多前因后果，2B感染的病毒和其他寄叶部队一样，都是寄叶基地后台统一投放的，其实本来应该全体寄叶都逃不过。全灭计划是前传中最初的九号设定的，从量产寄叶机体开始就已经计划好了全灭，目的是伪造已灭绝的人类还活在月球的假象并收集战斗数据给下一代人造人使用，寄叶部队全体都是计划中造神的殉道者，计划真正的全貌只有pod们知道，司令官只是顶头工具人，至于地堡炸了和寄叶全灭一样可以说属于预设好的计划一环，所有真正需要的数据不在地堡里而是存在pod们的数据网络里……E结局也不是全体都灭了，一些断网的寄叶就没事，在广播剧中有这个结局的后续

病毒是n2搞得，但是允许病毒进入的后门是建造寄叶部队之初就设定好的
就是要利用机械生命侵入后面消灭所有寄叶部队
寄叶计划：
人类灭亡的背景使得全体人造人都士气低落，因为人类已经太久没有出现了
所以很多人造人都怀疑人类已经灭亡
因此太空基地6号上的人造人科学家首次提出了寄叶计划
就是组建一直高度忠诚的部队，代表人类进行降下作战（解放地球）
从而让大家觉得人类还在
被首批选中的，就是最初版本的寄叶人造人机体，也就是原型机，其中最有名的就是2号和9号
只所以选择他们，就是因为寄叶人造人和抵抗军，人类军 人造人都不同，
他们的反应炉不需要补充水叶能持续工作
因为：他们有黑盒，而黑盒科技源于敌人——外星人制造的机械生命体！！！
所以，最初的寄叶人造人就被视为下等的存在，他们注定是要被消灭的，因为他们的血统！！
但是这个计划有个巨大的漏洞，就是寄叶部队本身也可能知道这个实情
最先知道的就是9号，9号杀死了6号基地的科学家，6号基地最终坠落地表
但他最后竟然莫名其妙的完善了整个寄叶计划
就是留有了后门，让机械生命体有机会灭亡寄叶部队，这样，所有秘密都被埋葬
另外还安排了执行的监控者群体，就是POD！！
有个小短片，在月球基地有个很隐蔽的地方，放着模拟人类存在的服务器
由一名寄叶人造人守护者，她从不知道自己的任务是什么
但是随着时间推移，总会发现一些什么，逃离，发现秘密，然后被POD处决
再被重启。。。。。。
后来，机械生命体不断进化，在整个种族的网络上，诞生了超级智慧体N2
N2早在最初的降下作战时就感知了地堡（第13号基地）的后门，并开始侵入了
游戏中B结局，9S驾驶载机去找2b时，都隐约出现过
首次降下作战，最初原型机都死亡了，只有2号活了下来，也就是A2
那时候A2就发下了，她是弃子
后来发生过很多次降下作战，均以失败告终，
9号原型机的后继者9S也曾经多次发现过寄叶部队的秘密
但是均被同行的2号原型机继任者2E（也就是2B）处决了
A2也不止一次被2B和9S追杀，都已斩杀9S和2B结局
这就如同一个诅咒，在不断的上演
人类的人造人，和外星人的机械生命体，这2个棋子，在棋手都已经不存在的情况下
不停的在棋盘上杀戮，没有尽头
机械生命体也跳不出这个诅咒，N2自己也很矛盾，她的敌人是人造人，所以应该消灭人造人
但是消灭了，就没有敌人了，她的存在就没有意义了，所以他们也在保护人造人
第243次降下作战，就是本作的开始，命运的齿轮发生了偏移
2B于9S的感情，帕斯卡的真诚，亚当夏娃的诞生，A2的改变，
让原本麻木的剧本不同了，
机械生命体的进化和独立意识让他们对战争产生了矛盾
也对人类的形态充满了向往，
而2b，9s，a2，也感受到了机械生命体并非都是杀戮机器，
这些改变，让战争的天平发生了倾斜，243次降下作战，终于还是接近成功了
于是，总攻开始，而其实一切，都在是N2的算计之中。。。。。。
结局：
不论是A2, 2B，9S，帕斯卡，亚当，夏娃，司令官，抵抗军，还有N2，都是棋子，
在一个没有意义的棋盘上进行着无尽的没有意义的杀戮
直到D结局，原本要彻底消灭人造人的N2，最终将毁灭机器白塔改为了方舟
去茫茫宇宙寻找人类，跳出了杀戮
直到E结局，原本监视寄叶计划的POD，诞生出自我的真实意志，修复了2B,9S和2A
也就是D，E是认定结局，N2，亚当，夏娃走了，2B,9S和2A活了，战争结束
脱离了网络的机械生命体，和幸存的人造人应该可以和平的相处了吧

游戏剧情打的爽就行了，本来就是随便乱搞的，搞完了就发设定集补剧情，有些都是硬来的，特别是前几部。

尼尔世界的人类因为魔素这个玩意，染上白盐病要灭绝了，所以制定了个灵肉分离计划，全体人类都把灵魂抽出来休眠，肉体安排人造人（粉毛姐妹这个型号的）监护看管，等魔素消失了再把灵魂装回来，这个就是监护者计划。然后为了保证人类肉体的鲜活，都会装一个虚假意识，结果虚假意识以为自己才是真的，有一个叫尼尔的虚假意识特别能打，就把前来讨要自己肉体的人类灵魂（鬼）都干掉了，然后失去原灵魂的肉体就也挂掉了，所以人类就灭亡了。大概是这么个剧情吧

我也有个问题，就是资料里说yorha部队是为了收集数据然后被废除再制造更加进化的部队，那地堡都没了新的yorha部队去哪里制造？人类早就没了那又是由谁来制造？制造出更加进化的yorha部队的目的又是啥？有大佬解答一下吗？

这游戏，单靠打游戏是打不明白全部剧情的，得靠游戏外补全设定和剧情的东西。我反正没去研究，主要是懒

既然人类都灭绝了，把他们这帮机械是干嘛的

我打到了三周目的A2，我只能回答一部分，2B的病毒是被感染的，9S是黑客相当于对病毒有抗体，之前没有在终端备份所以没有感染。2B之前就感染过病毒，刚开始感染的时候被9S救了。降落的时候因为和9S失联没办法才选择自杀。
另外几个问题建议了解一下前作，不了解前作很多彩蛋不理解，比如说那个艾米尔是尼尔的同伴，世界上最后半个人类了。这个抖音上好尸有详解。
最后我看的抖音视频还有一个真结局，2B和9S都死了，后来被辅助机救活了