单县古称单父，由舜帝的老师单卷居住地而得名。周成王封少子臻于此，为单子国。春秋初期，属宋国，后为鲁国单父邑。战国初期，复属宋国。宋灭，改属齐国。秦置单父县，属砀郡，此为单县建县之始。汉代三次为县侯国，一次为县王国。隋朝恢复单父县。唐末置辉州。明洪武元年（1368年）撤单父县，其地直属单州。次年7月，降单州为单县，单县由此定名，一直沿用至今。民国期间，先后属济宁道、曹濮道和国丄丨民党山东省第二专署、第十一专署。1939年，日本侵略军建伪单县公署。1940年３月，共丄丨产党在单县东南部张寨一带建立单县抗日政丨府。1943年7月，在单县东北部建立金曹县抗日政丨府。1944年6月，在单县西南部建立临河县抗日政丨府；9月以单县东南蔡堂、吴溜地区为依据建立砀山县（1947年曾一度改为华砀县）。1945年12月，临河县改为单虞县。1946年2月，撤销金曹县。1949年2月，砀山、虞城（东虞城）两县黄河故道以北地区，划归单虞县。1949年8月，平原省湖西专署机关进驻单县城，同时，撤销单虞县，恢复原建置，统称单县。1952年11月，随湖西专区改属山东省。1953年8月湖西专区撤销，单县归属菏泽专区。1958年12月，菏泽专区撤销，改属济宁地区。1959年7月，菏泽专区恢复，复属菏泽专区，现属菏泽市。
      1994年12月29日，撤销浮岗集乡、李新庄乡，设立浮岗集镇、李新庄镇。
      1998年11月9日，撤销李半庄乡，设立莱河镇。1998年底，单县辖37个乡镇。1999年12月22日，撤销杨楼乡，设立杨楼镇。
      2000年,千禧年,单县开始迈入经济发展的正轨.
      2001年，单县辖14个镇、6个乡：时楼镇、单城镇、莱河镇、孙溜镇、郭村镇、高韦庄镇、浮岗镇、黄岗镇、杨楼镇、蔡堂镇、朱集镇、终兴镇、徐寨镇、李新庄镇、谢集乡、高老家乡、曹庄乡、龙王庙乡、张集乡、李田楼乡。
      2002年5月14日，省政丨府批复同意：单县撤销龙王庙乡，设立龙王庙镇，其行政区域和人民政丨府驻地不变。截至2002年12月31日，单县辖16个镇、4个乡。