从事肛肠疾病和各种肛肠术后运用中医中药治疗的临床研究工作。
在应用祖国传统医学治疗慢性结肠炎方面，倡导用清、调、固三法经多年临床验证，取得比较满意的疗效。
参于著书4部，发表论文19篇，采用中医中药配合结扎新疗法治疗环状混合痔获得科技成果进步三等奖。

在几十年的诊疗实践和理论深造中不断学习吸收国内外肛肠名医治疗痔疾的经验和先进方法，逐渐形成了对痔疾及结肠炎的治疗特色，取得了专治经验，被誉为痔疾克星，刘昌林同志不但有高明的医术，同时也有高尚的医德，赢得了肛肠界人士和广大人民群众的交口称赞。