【生态谱系】是「水月与深蓝之树」集成战略主题附有的常驻奖励系统。【生态谱系】的每一级都有奖励，获取生机细胞提升笔记等级，解锁对应的等级奖励。在「水月与深蓝之树」主题持续更新的数月内，除首月外，每月初会增加【生态谱系】的等级上限，奖励也会持续增加。在「水月与深蓝之树」主题更新结束后，【生态谱系】的总奖励也将常驻存在，当前等级进度会保留，若未达到等级上限可继续获取生机细胞进行等级提升。