南通市区一共有多所高中，其中包括江苏省海门中学、江苏省南通中学、江苏省启东中学、江苏省江安高级中学、江苏省南通第一中学等。此外，南通市还有通州市金沙中学、江苏海安高级中学、江苏如东高级中学、海安县曲塘中学等普通高中。南通全市四星级高中总数达到30所，其中海门实验学校成为四星级高中。