变形金刚超能勇士的两个阵营是Autobots和Decepticons。Autobots是变形金刚超能勇士中的正义力量，由众多善良勇敢的机器人组成，代表仁义和真理，旨在为正义而战。Decepticons是变形金刚超能勇士中的邪恶势力，其成员以征服计划为宗旨，专门进行破坏活动，目的是控制宇宙中的一切。