主要方法有：1）改变过滤介质。改变过滤介质可以改变发酵液的过滤特性，包括更换滤膜材料或筛子的大小、孔径和精度；2）调节流体流速。经过滤过程中的流体流速可以影响悬浮颗粒的完整性，由此会对滤过程产生影响；3）改变温度和pH值。温度的升高会增强微生物酶反应的速度，而pH值的变化会影响微生物的活性，进而影响发酵液的过滤特性。