方正县共有九个乡镇,分别是新立乡、安家乡、许家乡、宝泉乡、索青乡、仁和乡、樊家乡、大河乡和孤店乡。新立乡位于方正县的中部,地处北纬45°58′,东经127°08′,与哈尔滨市相邻;安家乡位于方正县西南部,地处北纬45°54′,东经125°50′,距县城约25公里;许家乡位于方正县的中南部,地处北纬45°58′,东经126°12′,距县城约26公里;宝泉乡位于方正县的东北部,地处北纬46°03′,东经126°36′,距县城约22公里;索青乡位于方正县的西北部,地处北纬45°51′,东经126°04′,距县城约18公里;仁和乡位于方正县的西南部,地处北纬45°54′,东经125°49′,距县城约23公里;樊家乡位于方正县的西北部,地处北纬45°52′,东经126°25′,距县城约18公里;大河乡位于方正县的西中部,地处北纬45°55′,东经126°13′,距县城约20公里;孤店乡位于方正县的东南部,地处北纬45°53′,东经126°55′,距县城约15公里。