毕业证的穗颜色在不同的学校和不同的学位中可能有所不同。一般来说，学士学位的毕业证穗颜色是深蓝色或者天蓝色，硕士学位的毕业证穗颜色是深红色或者浅红色，博士学位的毕业证穗颜色是深黄色或者浅黄色。但是具体颜色还需要参考毕业证的制作标准和学校的规定。