MKV和MP4都是视频文件格式，但MKV可以容纳多个音频、字幕和视频流，支持更多的编码格式和高级功能（如菜单、章节等），但不是所有播放器都支持。而MP4则是一种通用格式，广泛支持于各种设备和媒体播放器，但功能相对较少。