宅基地内如果有古树，需要根据相关法律法规进行保护和处理。一般来说，宅基地内的古树属于自然资源，具有一定的保护价值。如果需要处理掉宅基地内的古树，需要先向当地林业部门申请，经过评估后才能进行相应的处理。在处理时，需要遵守相关法律法规，如《中华人民共和国森林法》等，确保不会破坏生态环境和生物多样性。如果需要砍伐古树，应该由专业的林业人员进行操作，避免对周围环境和其他植物造成不良影响。同时，也需要考虑到当地的文化和历史价值，如果古树属于文化遗产或历史文物，需要经过相应的部门批准后才能进行处理。