自动化动作的生理机理是以神经系统中所揭示的高级神经活动的基本规律为基础的。这些规律涉及整合性神经元的活动，例如传入和传出信号的处理，启动和抑制信号的协调以及记忆和反射机制的运作等。这些机制可以促进自动化动作的执行，并改善和加速它们的执行速度和精度。在大脑的基底节区域，还发现了许多与自动化动作相关的神经中枢，如基底节和小脑等，它们负责协调和调节肌肉活动，从而使动作更协调、更平稳。