新疆巴音郭楞蒙古自治州的大学有：1.巴音郭楞职业技术学院：位于库尔勒市。是一所涵盖多个领域的全日制普通高校，包括经济、管理、艺术等专业。2.库尔勒师范学院：位于库尔勒市。是一所本硕连读的普通高等师范院校，以师范教育为主，拥有教育、文学、法学等专业。3.新疆警察学院巴音郭楞分院：位于巴州区。是新疆警察学院在巴州区设立的二级学院，主要培养警务专业人才。4.库尔勒学院：位于库尔勒市。是一所本科普通高校，学校设有文学、教育、法学、经济、管理、理学、艺术、历史和民族学等专业。5.新疆天山职业技术学院巴州分院：位于巴州区。是新疆天山职业技术学院在巴州区设立的分院，主要培养各类应用型高级技术人才。