鞋子晒过真菌能有效去除一部分真菌，但具体去除的数量取决于鞋子内部的真菌种类、数量、存活时间和环境等因素。同时，不同的真菌具有不同的生存环境和特性，可能需要使用不同的清洁方法来进行彻底清除。因此，在对鞋子进行清洁和消毒时，应该根据实际情况采取合适的措施，以确保去除尽可能多的真菌。