甘井子区第三中学包括甘井子第三中学、甘州第三中学、大洋中学、甘井子第一中学、甘井子第五中学和甘井子第六中学。甘井子第三中学是该区最古老的中学，成立于1954年，是一所百年名校；甘州第三中学成立于1973年，是一所具有教育改革精神的特色学校；大洋中学成立于2002年，是一所专注于个性培养、创新型学习理念的民办学校；甘井子第一中学、第五中学和第六中学分别成立于2004年、1998年和1997年，同样是该区优秀学校。