中科院京都办公室目前包括中国科学院动物研究所、中国科学院化学研究所、中国科学院地理科学与资源研究所、中国科学院生态环境研究中心、中国科学院植物研究所、中国科学院数学与系统科学研究院、中国科学院地球化学研究所、中国科学院金属研究所等。中科学院京都办公室是中科院在北京市的一个独立机构，以及国家的科技创新和人才引进中心。京都办公室负责协调、宣传和监督中科院来京的各种项目，包括科学研究、科技合作、人才引进、科技金融服务、科技政策咨询等。中科院京都办公室在京都的存在不仅起到了促进中科院京都研究工作的作用，也为中国科技的发展做出了积极贡献。目前，京都办公室在智库研究、科技政策分析、科技成果转化和服务创新等多方面展开积极活动，促进中科院与北京市政府、企业的合作，并将其成果转化到实际应用。