知乎上看到的一个观点，个人还比较认同，摘录如下：
小龙女出场的时候已经18岁了。。。
林朝英推理来看是有耳洞的，林朝英的徒弟(侍女，小龙女的师父)也应该有。古墓派也就只有小龙女根正苗红从没出过古墓(24岁以前)，那么问题来了，究竟是谁帮她打的耳洞呢？我猜想是李莫愁，用的很可能是金、银针(金的是玉蜂针，银的就不用多讲了，当然都是没毒的)。
李莫愁爱美，在师父没赶走她之前，应该对小龙女是十分喜爱的。古墓派对美的事物应该不排斥，必竟在生活这么坚苦的环境下还教会了小龙女抚琴，而且，她音乐造诣很高，能从音乐中推想武功。
以上是我瞎想的，可能金庸先生也没多做考虑。还有一种可能就是古代大户人家的女儿，生下来就打耳洞(不可考证)。
坐等大神回答。