以下是北京儿童医院的一些专业科室，这些科室在相应领域具有较高的声誉和专业水平：
儿科：包括常见儿科疾病、新生儿科、儿童内分泌、儿童呼吸等。
小儿外科：处理小儿手术、疝气、先天性心脏病等。
小儿神经科：处理小儿脑瘫、癫痫、脑积水等神经系统疾病。
小儿心脏科：专注于小儿心脏疾病的诊断和治疗。
小儿肾脏科：处理小儿肾病、尿路感染、肾功能障碍等。
小儿血液科：处理小儿血液病、白血病、血友病等。
小儿骨科：处理小儿骨折、畸形、先天性髋关节脱位等。