氢氧化钠溶液澄清石灰水不能鉴别二氧化碳的原因是，二氧化碳和氢氧化钠反应生成碳酸钠，而碳酸钠会被溶解在水中，不会产生沉淀，因此无法观察到明显的化学反应。而如果使用酸性物质如盐酸，二氧化碳会与盐酸反应产生气体，可以观察到气泡的产生，从而鉴别二氧化碳。