当三菱加工中心的零点丢失时，可以通过重新设置零点来解决问题。具体操作方法如下：首先，找到机床的手动操作面板，选择“参考点设定”选项，进入设定界面。然后，按照提示进行操作，将设备移动到正确的位置，并按下“设定”按钮，保存新的零点位置。最后，进行一次试切，确保加工精度符合要求。