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南方科技大学的专业主要包括，机械与车辆工程、能源动力与流体工程、电子科学与工程、生物科学、信息工程、经济管理、法律、计算机科学与技术、外国语言文学、数学与应用数学、理学、公共管理等。南方科技大学划分为六个学院，分别是机械与车辆工程学院、能源动力与流体工程学院、电子科学与工程学院、生物科学学院、信息工程学院和管理学院，其中机械与车辆工程学院、能源动力与流体工程学院、电子科学与工程学院三个学院是该校教育部直属重点学科，下设机械工程、机械设计、机械制造及自动化、能源动力工程、流体机械及工程、电子科学与技术、光电信息科学与工程等等不同的专业。此外，南方科技大学还开设了一些新的专业例如网络空间安全、智能计算、机器学习、大数据分析等，以满足新时代人才培养需求，提升学生就业竞争力。
