是的，在满足相应条件的情况下，申请专项附加扣除后仍然可以退税。新版个税法有针对专项附加扣除实施将其纳入适用范围的规定，同时还规定，应纳税人在申报纳税年度应纳税所得额中，抵扣专项附加扣除之前，可以先抵扣适用的税前扣除项目，如子女教育、住房贷款利息等，再进行专项附加扣除，最后根据居民所得税税率表计算应纳税所得额的应纳税额，并减去相应的应补税额。有些符合条件的纳税人申请了专项附加扣除后仍然可以获得税收优惠，但专项附加扣除不能只抵扣当期应纳税额、当期应退税额不够抵扣时，应计算出差额，申请转嫁下期应纳税额金额。