最好的细菌屋材料是石英砂或粗沙，厚度在3-5厘米之间。这种材料会提供良好的效果，可以提高水质，减少水变浑浊、氨气升高的可能性。它的大粒子尺寸可以吸收硅藻和藻类的繁殖，从而可以促进水体的微生物平衡，使水质更加透明、清澈。此外，由于它具有良好的空气交换和蓄水性能，所以它也可以作为水族缸的水底材料。此外，也可以使用植物或活性炭来净化水体，这样可以提高鱼类的存活率。