灵活就业者通常需要自行负责五险一金的缴纳，而公司员工则由公司代为缴纳。此外，灵活就业者的五险一金缴纳标准和计算方式也有所不同。同时，灵活就业者的社保福利待遇也会有所不同，比如在退休、生育等方面可能会受到影响。